More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4192 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  100 
 
 		 234 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  89.87 
 
 		 235 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  81.99 
 
 		 234 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  81.99 
 
 		 234 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  81.99 
 
 		 234 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  76.78 
 
 		 240 aa  330  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  67.79 
 
 		 249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  64.55 
 
 		 262 aa  279  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  60.34 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  58.67 
 
 		 240 aa  261  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  63.13 
 
 		 252 aa  251  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  59.56 
 
 		 268 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  59.55 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  57.4 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  60.09 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  65.93 
 
 		 250 aa  245  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  58.9 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  63.81 
 
 		 267 aa  243  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  57.41 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  53.64 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  55.95 
 
 		 276 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  56.68 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  58.11 
 
 		 306 aa  235  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  57.73 
 
 		 234 aa  231  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  58.26 
 
 		 267 aa  230  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  62.88 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  55.66 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  60.62 
 
 		 270 aa  225  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  58.08 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  59.09 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  52.42 
 
 		 240 aa  222  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  59.46 
 
 		 243 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  51.98 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  47.96 
 
 		 220 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  52.7 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  48.65 
 
 		 242 aa  187  9e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  45.98 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  42.73 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  46.23 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  48.53 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  44.64 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  46.57 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  46.23 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  46.7 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  44.02 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  45.28 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  42.72 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  42.34 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  42.34 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  40.71 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  42.98 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.57 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  43.2 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  40 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  42.72 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.64 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  43.46 
 
 		 237 aa  154  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  42.18 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  43.33 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  39.81 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  40.48 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  44.61 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  40.09 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  46.57 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  44.91 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  40.74 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  44.12 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  42.65 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  46.5 
 
 		 282 aa  149  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  41.51 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  43.18 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  41.12 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  43.37 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  40 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  41.33 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  43.15 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  38.1 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  43.81 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  41.94 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  41.31 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  48.82 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  41.81 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  41.51 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  39.72 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  36.89 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  39.72 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  40.77 
 
 		 236 aa  141  9e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  39.57 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  42.86 
 
 		 385 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  39.47 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  39.25 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  42.27 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  40.65 
 
 		 377 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  41.23 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  43.72 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  40.74 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  40.71 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  42.4 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  38.68 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  40 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>