More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7995 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  100 
 
 		 243 aa  484  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  83.47 
 
 		 267 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  74.06 
 
 		 240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  77.88 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  71.93 
 
 		 246 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  76.61 
 
 		 248 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  67.39 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  66.52 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  71.16 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  67.12 
 
 		 306 aa  271  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  67.45 
 
 		 276 aa  270  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  65.93 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  65.89 
 
 		 249 aa  265  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  72.25 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  59.11 
 
 		 234 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  64.76 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  60.18 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  60.19 
 
 		 242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  59.36 
 
 		 240 aa  252  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  65.22 
 
 		 267 aa  251  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  62.8 
 
 		 249 aa  248  5e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  65.64 
 
 		 224 aa  248  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  61.75 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  61.84 
 
 		 240 aa  244  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  70.3 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  59.05 
 
 		 234 aa  241  7e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  53.81 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  64.38 
 
 		 250 aa  239  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  56.62 
 
 		 252 aa  234  9e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  58.41 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  58.45 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  58.45 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  58.45 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  53.22 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  53.74 
 
 		 220 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  47.73 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  52.36 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  46.88 
 
 		 242 aa  188  8e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  47.53 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  48.13 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  50.72 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  44.08 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  47.37 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  43.6 
 
 		 236 aa  177  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  47.83 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  45.18 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  43.95 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  42.22 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  46.67 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  48.11 
 
 		 385 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  48.11 
 
 		 383 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  46.15 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  45.12 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  43.81 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  48.11 
 
 		 383 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  47.5 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  44.02 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  42.53 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  43.3 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  47.62 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  39.44 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  39.44 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  43.83 
 
 		 377 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  42.86 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  47.34 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  43.04 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  41.06 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  45.59 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  43.95 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.19 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  39.19 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  40 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  39.41 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  40.68 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  39.42 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  41.44 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  39.53 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  49.51 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  36.74 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  48.17 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  40.47 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  40.47 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  39.01 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  50.97 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  39.9 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  41.55 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  39.81 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  44.04 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  41.23 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  38.3 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  38.03 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  38.16 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  45.88 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  41.71 
 
 		 223 aa  149  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  41.62 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  41.62 
 
 		 245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  41.62 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  39.13 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>