More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2780 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  100 
 
 		 267 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  79.48 
 
 		 240 aa  363  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  83.47 
 
 		 243 aa  338  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  78.45 
 
 		 268 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  79.72 
 
 		 248 aa  327  9e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  72.73 
 
 		 246 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  68.58 
 
 		 252 aa  289  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  73.3 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  69.63 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  65.92 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  60.43 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  65.7 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  66.36 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  64.6 
 
 		 243 aa  271  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  67.46 
 
 		 270 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  58.26 
 
 		 234 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  62.5 
 
 		 262 aa  259  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  60.85 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  66.15 
 
 		 224 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  57.33 
 
 		 242 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  59.72 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  62.1 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  61.84 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  61.84 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  57.8 
 
 		 234 aa  245  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  62.55 
 
 		 250 aa  244  9e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  53.98 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  63.03 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  57.87 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  59.64 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  56.82 
 
 		 239 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  59.9 
 
 		 234 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  59.9 
 
 		 234 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  59.9 
 
 		 234 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  53.52 
 
 		 220 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  55.02 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  48.25 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  48.64 
 
 		 230 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  51.92 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  49.13 
 
 		 242 aa  196  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  49.07 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  51.67 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  45.33 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  46.86 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  49.76 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  46.15 
 
 		 236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  44.13 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  49.07 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  44.5 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  41.98 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  44.8 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  44.89 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  48.77 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  43.69 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  45.59 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  46.15 
 
 		 241 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  49.24 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  47.18 
 
 		 246 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  47.66 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  44.61 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  45.74 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  47.74 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  41.59 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  41.59 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  43.2 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  44.02 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  48.97 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  49.48 
 
 		 383 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  49.48 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  42.93 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  44.34 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  42.06 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  48.97 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  44.13 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  45.63 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  44.02 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  38.5 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  38.5 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  42.92 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  40.55 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  48.17 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  48.79 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  41.87 
 
 		 222 aa  159  6e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  42.18 
 
 		 225 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  42.18 
 
 		 225 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  44.93 
 
 		 228 aa  158  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  38.46 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  38.1 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  42.92 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  38.01 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  40.28 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  41.15 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  47.26 
 
 		 248 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  40.57 
 
 		 236 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  41.95 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  50.24 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  42.06 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  39.71 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  41.9 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  37.96 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>