More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1060 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  100 
 
 		 232 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  94.4 
 
 		 232 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  64.16 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  54.87 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  57.6 
 
 		 248 aa  215  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  49.78 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  49.11 
 
 		 259 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  53.18 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  48.26 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  46.4 
 
 		 232 aa  187  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  49.34 
 
 		 377 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  46.02 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  48.56 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  43.98 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  49.77 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  49.76 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  49.54 
 
 		 385 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  49.78 
 
 		 383 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  50.23 
 
 		 383 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  47.32 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  48.6 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  44.24 
 
 		 246 aa  174  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  50.24 
 
 		 246 aa  174  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  43.11 
 
 		 226 aa  174  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  42.01 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  47.22 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  44.84 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  45.91 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  44.09 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  42.41 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  44.7 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  45.1 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  43.95 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  44.09 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  49.51 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  45.5 
 
 		 262 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.68 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  45.78 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  43.69 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  42.03 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  44.49 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  39.22 
 
 		 233 aa  168  8e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  42.13 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  45.81 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  41.96 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  42.99 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  43.52 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  43.75 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  46.3 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  39.73 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  44 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  44 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  43.27 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  44.34 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  40.08 
 
 		 239 aa  162  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  43.3 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  43.52 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  41.41 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  44.7 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  46.26 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  39.83 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  44.65 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  45.75 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  42.41 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  40.27 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  43.19 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  44.06 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  44.06 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  41.28 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  41.28 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  41.86 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  41.86 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  44.19 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  41.67 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  37.9 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40.83 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  40.62 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  44.55 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40.83 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  42.92 
 
 		 256 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  39.82 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  42.92 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  47.52 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  42.92 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  41.96 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  39.55 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  43.78 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  45.12 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  39.55 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  43.56 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  43.93 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  40.54 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  45.37 
 
 		 259 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  40 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  45.12 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  41.52 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  47.24 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  40.09 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  43.78 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  44.71 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>