More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8017 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  100 
 
 		 276 aa  550  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  65.82 
 
 		 246 aa  311  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  71.96 
 
 		 240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  71.5 
 
 		 248 aa  288  8e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  67.51 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  66.67 
 
 		 252 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  66.67 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  62.16 
 
 		 249 aa  265  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  73.3 
 
 		 267 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  62.84 
 
 		 243 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  66.15 
 
 		 224 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  64.39 
 
 		 276 aa  255  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  60.09 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  64.81 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  63.83 
 
 		 250 aa  252  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  55.95 
 
 		 234 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  71.16 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  57.87 
 
 		 252 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  57.26 
 
 		 240 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  65.4 
 
 		 270 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  58.45 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  58.74 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  60.56 
 
 		 249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  61.17 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  61.7 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  52.27 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  53.22 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  58.56 
 
 		 228 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  58.18 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  53.42 
 
 		 234 aa  229  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  57.35 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  57.35 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  57.35 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  64.22 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  52.4 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  48.95 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  46.82 
 
 		 230 aa  185  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  45.58 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  48.78 
 
 		 235 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  50 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  44.76 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  42.86 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  46.86 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  44.44 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  46.19 
 
 		 377 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  44.8 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  46.98 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  45.54 
 
 		 236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  43.81 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  44.08 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  47.14 
 
 		 385 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  47.06 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  44.23 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  44.71 
 
 		 241 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  46.7 
 
 		 383 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  46.7 
 
 		 383 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  43.54 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  45.1 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  49.24 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  41.26 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  45.59 
 
 		 233 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  37 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  43.88 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  40.19 
 
 		 248 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  41.41 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  40.53 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.25 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  42.92 
 
 		 231 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  40.28 
 
 		 237 aa  159  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  43.4 
 
 		 236 aa  159  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  45.15 
 
 		 240 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  43.75 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  44.55 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  43.65 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  40.76 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  36.67 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  36.67 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  43.56 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  45.45 
 
 		 260 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  34.98 
 
 		 245 aa  151  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  37.93 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  44.23 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  43.14 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  44.44 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  46.07 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  42.72 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  42.72 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  44 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  38.76 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  42.86 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  37.66 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  39.73 
 
 		 240 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  41.41 
 
 		 243 aa  149  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  42.72 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  42.72 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  42.72 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  42.72 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  42.72 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  42.72 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  40.65 
 
 		 222 aa  148  9e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>