More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2239 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  91.03 
 
 		 240 aa  387  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  57.39 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  58.72 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  58.74 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  57.76 
 
 		 268 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  55.61 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  58.45 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  57.33 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  57.21 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  54.67 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  53.65 
 
 		 252 aa  235  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  55.31 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  52.86 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  54.08 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  51.98 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  55.3 
 
 		 252 aa  231  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  58.12 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  55.5 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  55.24 
 
 		 276 aa  228  9e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  60.19 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  57.73 
 
 		 306 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  55.88 
 
 		 249 aa  224  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  53.81 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  50.41 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  59.55 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  58.03 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  52.7 
 
 		 235 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  50.49 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  50.49 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  50.49 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  51.33 
 
 		 243 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  56.31 
 
 		 270 aa  209  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  56.83 
 
 		 270 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  51.12 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  49.03 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  45.78 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  42.6 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  43.69 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  42.16 
 
 		 236 aa  168  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  39.68 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  44 
 
 		 242 aa  161  8.000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  41.63 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  42.86 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  39.91 
 
 		 259 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  43.4 
 
 		 377 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  41.18 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  45.02 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  41.18 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  39.46 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  41.12 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  40.38 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  41.06 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  43.14 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  35.27 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  41.71 
 
 		 383 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  41.33 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  37.5 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  41.71 
 
 		 383 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  41.71 
 
 		 385 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  38.64 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  38.64 
 
 		 241 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  39.35 
 
 		 242 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  39.23 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  37.44 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  37.33 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  35.84 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  37.87 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  37.45 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  38.86 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  35.37 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  40.1 
 
 		 233 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  37.39 
 
 		 235 aa  141  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  35.02 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  35.04 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  40.31 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  35.11 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  32.88 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  40.35 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  39.81 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0492  ribonuclease III  33.93 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.863648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  38.16 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  39.19 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  36.14 
 
 		 222 aa  135  8e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  36.18 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  34.31 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  34.31 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  42.66 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  41.28 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  36.12 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  38.74 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  35.87 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  39.01 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  38.71 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  39.62 
 
 		 256 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  35.14 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  39.62 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  39.11 
 
 		 228 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  39.62 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  36.36 
 
 		 223 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>