More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0492 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0492  ribonuclease III  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.863648  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  58.52 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  40.72 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  42.08 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  40.79 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  40.61 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  40.69 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  40.61 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  40.61 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  40.61 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  37.44 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  40.09 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  40.61 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  40.61 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  40.61 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  40.61 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  40.61 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  38.05 
 
 		 235 aa  148  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  38.01 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  39.65 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  36.94 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  43.75 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  36.36 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  35.91 
 
 		 377 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  36.84 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  38.64 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  36.84 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  35.65 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  37.62 
 
 		 383 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  37.62 
 
 		 383 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  35.93 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  38.25 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1565  ribonuclease III  39.71 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  35.16 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  38.01 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  36.7 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  35.11 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  36.19 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  38.18 
 
 		 241 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  38.18 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  36.15 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  36.15 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  38.74 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  37.79 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  38.96 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  36.57 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  33.33 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  33.48 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  37.62 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  36.15 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  35.68 
 
 		 234 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  35.58 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  35.98 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  34.63 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  37.1 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  36.09 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  34.63 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  35.06 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  36.56 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  37.77 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  36.64 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  39.56 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  33.62 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  39.15 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0196  ribonuclease III  38.26 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.483846  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  36.21 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  35.55 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  31.7 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  37.05 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  35.27 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  40.35 
 
 		 246 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  37.05 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  35.24 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0650  ribonuclease III  34.58 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.397443 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  31.43 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  37.1 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  36.82 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  33.33 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  35.43 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  35.1 
 
 		 229 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  37.1 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  37.1 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  37.22 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  34.03 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  36.49 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  33.33 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  33.18 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  33.18 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  35.17 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  39.5 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  35.34 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  34.91 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  31.16 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  36.45 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  40.19 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  32.37 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  32.91 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  35.16 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  38.12 
 
 		 282 aa  118  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  41.72 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>