More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1159 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  100 
 
 		 222 aa  440  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  41.7 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  40.87 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  40.27 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.55 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  41.82 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  38.18 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.2 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  36.94 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  36.94 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40.09 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40.09 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  41.41 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  39.46 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  44 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  39.81 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  44 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  44 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  38.33 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  39.37 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  40.76 
 
 		 231 aa  141  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  39.91 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  37.9 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  39.23 
 
 		 262 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  34.08 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  36.89 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  41.31 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  40.38 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  37.61 
 
 		 239 aa  138  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  34.7 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  39.62 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  38.07 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  36.53 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  34.23 
 
 		 259 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  37.75 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  36.06 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  37.62 
 
 		 239 aa  134  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  37.11 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  36.41 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  34.86 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.81 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  39.37 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  38.03 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  36.32 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  37.96 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  37.1 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  34.67 
 
 		 246 aa  131  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  34.82 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  34.42 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  36.89 
 
 		 245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  33.48 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  35 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  36.89 
 
 		 245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  36.52 
 
 		 232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  36.89 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  36.89 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  36.89 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  36.41 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  36.89 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  36.41 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  35.14 
 
 		 377 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  33.49 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  36.89 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  40.3 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  35.27 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  35.92 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  36.73 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  35.51 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  33.49 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  35.51 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  36.62 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  34.53 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  35.87 
 
 		 271 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  35.48 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  35.12 
 
 		 240 aa  128  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  34.93 
 
 		 233 aa  128  9.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  33.64 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  35.15 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  35.55 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  35.55 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  35.48 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  34.84 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  34.08 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  35.05 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  34.31 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  36.96 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  34.55 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  35.91 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  31.98 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  33.49 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  35.12 
 
 		 276 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  36.28 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  36.5 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  35.89 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  34.08 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  34.56 
 
 		 237 aa  124  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  34.08 
 
 		 256 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  36.1 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  36.1 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  35.11 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>