More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1604 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  100 
 
 		 231 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  51.54 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  44.05 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  43.04 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  43.04 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  42.86 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  42.41 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  40.26 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  40.19 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  36.99 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  40.47 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  40.54 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  39.56 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  40.47 
 
 		 245 aa  144  8.000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  38.05 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  38.39 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  39.91 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  36.67 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  44.39 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  40.76 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  36.04 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  36.36 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  36.79 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  43.32 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  39.04 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  39.04 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  34.67 
 
 		 248 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  39.11 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  40.09 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  38.6 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  41.2 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  34.82 
 
 		 377 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  34.07 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  37.5 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  39.25 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  34.63 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  34.65 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  35.14 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  36 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  34.22 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  34.42 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  39.25 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0281  ribonuclease III  38.42 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  36.65 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  36.44 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  34.82 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  37.22 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  36.2 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  37.33 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  34.51 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  34.2 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  33.49 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  38.65 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  37.21 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  33.94 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  36.15 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  40.83 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  35.91 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  35.71 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  35.94 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  36.8 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  34.08 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  35.5 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  38.99 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  38.99 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  37.05 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  35.43 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  37.28 
 
 		 252 aa  131  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  38.53 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  33.33 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  38.07 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  33.02 
 
 		 383 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  36.41 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  38.53 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  36.41 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  35.56 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  33.02 
 
 		 383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  37.67 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  35.29 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  38.53 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  35.29 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  35.29 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  38.21 
 
 		 276 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  36.79 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  33.33 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  37.66 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  34.27 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  31.22 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  34.82 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  38.57 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  35.48 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  31.22 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  37.61 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  37.61 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  37.33 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  37.61 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  37.5 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  35.16 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  33.91 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  35.29 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>