More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2069 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  62.71 
 
 		 259 aa  308  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  62.84 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  57.59 
 
 		 235 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  46.52 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  50.23 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  50.65 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  47.53 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  47.44 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  50.47 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  49.76 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  47.96 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  51.9 
 
 		 262 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  45.16 
 
 		 241 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  44.7 
 
 		 241 aa  208  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  44.21 
 
 		 243 aa  205  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  44.21 
 
 		 243 aa  205  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  50.72 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  44.92 
 
 		 246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  47.32 
 
 		 229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  45.5 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  46.19 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  45.37 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  49.29 
 
 		 385 aa  194  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  44.91 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  44.91 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  46.19 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  43.17 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  44.91 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  44.91 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  44.91 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  44.84 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  44.91 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  44.91 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  44.91 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  48.82 
 
 		 383 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  44.91 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  48.82 
 
 		 383 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  48.15 
 
 		 377 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  43.98 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  45.22 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  50.49 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  42.42 
 
 		 233 aa  188  8e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  43.61 
 
 		 222 aa  188  8e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  45.74 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  42.31 
 
 		 233 aa  188  9e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  43.04 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  47.62 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  42.86 
 
 		 240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  43.75 
 
 		 240 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  43.5 
 
 		 229 aa  182  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  43.1 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  43.05 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  43.11 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  44.93 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  44.39 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  46.38 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  42.86 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  46.53 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  43.5 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  41.07 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  43.4 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  48.02 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  42.79 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  45.79 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  42.79 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  43.89 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  44 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  45.02 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  43.48 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  42.61 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  44.44 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  41.63 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  45.54 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  40 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  49.78 
 
 		 232 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  41.89 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  42.79 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  43.81 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  41.44 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  41.44 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  37.5 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  42.73 
 
 		 266 aa  168  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  44.86 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  43.93 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  42.6 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  44.34 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  40.54 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  47.21 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  42.73 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  43.27 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  42.79 
 
 		 242 aa  164  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  40.89 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  42.29 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  42.22 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  46.23 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  42.15 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  46.7 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  40.27 
 
 		 222 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  41.36 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>