More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3545 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  100 
 
 
282 aa  566  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  49.09 
 
 
236 aa  205  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  50 
 
 
377 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  48.21 
 
 
242 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  45.13 
 
 
226 aa  186  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  47.56 
 
 
383 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  47.56 
 
 
383 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  46.33 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  47.15 
 
 
385 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  45.85 
 
 
230 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  45.71 
 
 
236 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  46.7 
 
 
231 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  47.47 
 
 
240 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  50 
 
 
240 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  42.11 
 
 
223 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  42.86 
 
 
225 aa  176  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  43.5 
 
 
235 aa  175  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  42.86 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  42.4 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  44.89 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  46.29 
 
 
246 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  42.86 
 
 
223 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  39.73 
 
 
236 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  39.19 
 
 
233 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  45.87 
 
 
228 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  45.02 
 
 
246 aa  168  8e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  41.67 
 
 
222 aa  167  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  47.35 
 
 
233 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  45.12 
 
 
222 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  47.93 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  42.79 
 
 
237 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  43.75 
 
 
248 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  41.86 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  49.51 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  41.67 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  44.91 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  44.49 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  43.33 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  42.59 
 
 
229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  41.44 
 
 
248 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  48.7 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  41.15 
 
 
223 aa  162  6e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  39.17 
 
 
231 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  46.92 
 
 
243 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  46.7 
 
 
234 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  47.2 
 
 
230 aa  161  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  49.75 
 
 
248 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  40.91 
 
 
231 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  43.69 
 
 
233 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  48.73 
 
 
249 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  43.93 
 
 
228 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  43.98 
 
 
230 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1196  ribonuclease III  46.82 
 
 
228 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0711323  decreased coverage  0.00493903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  48.47 
 
 
252 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  46.43 
 
 
232 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  40.09 
 
 
243 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  40.09 
 
 
243 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3854  ribonuclease III  44.3 
 
 
258 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  40.43 
 
 
239 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  41.96 
 
 
246 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  48.53 
 
 
228 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  41.18 
 
 
241 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  41.18 
 
 
241 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  43.29 
 
 
235 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  48.24 
 
 
228 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  46.15 
 
 
248 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  40.69 
 
 
246 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  46.77 
 
 
241 aa  156  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  48.24 
 
 
228 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  41.74 
 
 
236 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  46.76 
 
 
222 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  43.23 
 
 
228 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  42.73 
 
 
263 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  47.32 
 
 
232 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  47.96 
 
 
252 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  44.16 
 
 
236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  42.13 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  44 
 
 
235 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1402  ribonuclease III  46.82 
 
 
228 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  45.91 
 
 
256 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  45.91 
 
 
256 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  48.7 
 
 
267 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  35.16 
 
 
246 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  47.35 
 
 
268 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  45.6 
 
 
263 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  45.25 
 
 
227 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  46.63 
 
 
276 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  40.74 
 
 
227 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  43.58 
 
 
229 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  43.58 
 
 
229 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  44.55 
 
 
259 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  43.78 
 
 
229 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  45.74 
 
 
248 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  45.74 
 
 
248 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  43.78 
 
 
229 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  44.8 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  44.95 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  37.61 
 
 
245 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  47.09 
 
 
226 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  47.37 
 
 
240 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>