More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1778 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  100 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  47.11 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  47.96 
 
 		 240 aa  191  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  44.76 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  47.55 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  45.54 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  49.31 
 
 		 240 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  45.69 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  44.44 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  43.53 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  45.28 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  44.25 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  43.38 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  46.4 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  40.97 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  44.69 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  42.79 
 
 		 233 aa  171  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  46.95 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  39.82 
 
 		 236 aa  171  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  44.04 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.29 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  43.05 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  48.61 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  42.53 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  42.66 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.09 
 
 		 236 aa  164  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  46.76 
 
 		 282 aa  164  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  47.09 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  43.38 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  40.27 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  40.85 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  36.04 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  41.15 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  45.28 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  40.77 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  40.79 
 
 		 246 aa  161  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  43.58 
 
 		 377 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  41.33 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  39.01 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  42.36 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  49.54 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  46.34 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  42.79 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  42.79 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  41.52 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  41.96 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  43.96 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  45.05 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  37.27 
 
 		 241 aa  157  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  41.96 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  41.15 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  44.29 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  47.91 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  42.27 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  45.45 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  36.82 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  45.07 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  42.67 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  37.23 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  41.82 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  41.82 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  44.55 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  40.43 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  41.59 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  40 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  36.36 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  37.44 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  42.38 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  42.24 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  38.68 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  38.21 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  38.12 
 
 		 223 aa  154  9e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  42.27 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  40.38 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  44.17 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  43.15 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  44.5 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  42.79 
 
 		 222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  42.08 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  35 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  43.18 
 
 		 256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  42.86 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  42.27 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  42.65 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  42.86 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  41.28 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  40.89 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  41.74 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  42.6 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  42.38 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  41.63 
 
 		 233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  42.38 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  42.38 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  44.1 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  48.6 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  42.47 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  42.73 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  43.81 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  37.27 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  36.94 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>