More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2807 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  100 
 
 
246 aa  491  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  44.29 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  45.25 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  42.17 
 
 
225 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  37.28 
 
 
240 aa  175  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  40.36 
 
 
223 aa  175  5e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  36.73 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  42.22 
 
 
236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  39.45 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  39.29 
 
 
221 aa  172  5.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  42.92 
 
 
225 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  43.22 
 
 
235 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  39.11 
 
 
229 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  38.5 
 
 
223 aa  170  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  36.73 
 
 
235 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  38.22 
 
 
236 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  37.5 
 
 
246 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  42.59 
 
 
236 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  41.18 
 
 
234 aa  168  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  39.73 
 
 
226 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  38.3 
 
 
241 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  38.3 
 
 
241 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  37.5 
 
 
246 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  39.23 
 
 
246 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  37.44 
 
 
230 aa  165  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  39.3 
 
 
238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  40.27 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  40.19 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  40.6 
 
 
239 aa  163  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  40.91 
 
 
231 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  36 
 
 
248 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  37.05 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  39.35 
 
 
240 aa  161  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  38.74 
 
 
226 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  37.78 
 
 
246 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  36 
 
 
228 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  38.22 
 
 
246 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  35.96 
 
 
240 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  36.16 
 
 
229 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  35.56 
 
 
237 aa  159  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  39.81 
 
 
240 aa  159  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  38.79 
 
 
259 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  35.17 
 
 
235 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  38.81 
 
 
226 aa  158  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  37.1 
 
 
228 aa  158  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  44.39 
 
 
236 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  38.74 
 
 
226 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  37.72 
 
 
225 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  36.84 
 
 
237 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  39.6 
 
 
233 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  38.74 
 
 
226 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  38.74 
 
 
226 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  38.74 
 
 
226 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  38.74 
 
 
226 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  41.01 
 
 
231 aa  156  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  38.74 
 
 
226 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  34.89 
 
 
246 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  37.95 
 
 
300 aa  156  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  37.72 
 
 
224 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  36.82 
 
 
230 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  37.72 
 
 
225 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  38.74 
 
 
226 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  38.74 
 
 
226 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  38.74 
 
 
226 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  41.48 
 
 
231 aa  155  6e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  36.96 
 
 
242 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  32.47 
 
 
377 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1243  ribonuclease III  40.47 
 
 
225 aa  155  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000271922  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  36.89 
 
 
230 aa  154  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  35.11 
 
 
248 aa  154  9e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  37.61 
 
 
248 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  36.82 
 
 
228 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  38.29 
 
 
226 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  37.74 
 
 
223 aa  154  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  41.4 
 
 
229 aa  154  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  35.29 
 
 
232 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  35.29 
 
 
226 aa  154  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  34.82 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  38.39 
 
 
225 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  36.6 
 
 
242 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  37.5 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  34.91 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  40.29 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  40.29 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  35.75 
 
 
227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  35.15 
 
 
256 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  40.29 
 
 
245 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  40.29 
 
 
245 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  40.29 
 
 
245 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  35.56 
 
 
279 aa  150  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  40.29 
 
 
245 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  38.28 
 
 
233 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  36.32 
 
 
228 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  40.29 
 
 
245 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  40.29 
 
 
245 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  39.15 
 
 
245 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  37.69 
 
 
252 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  35.24 
 
 
222 aa  151  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  40.29 
 
 
245 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  39.32 
 
 
245 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>