More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0453 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  100 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1565  ribonuclease III  65.7 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  49.33 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  46.49 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  46.29 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  51.9 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  46.61 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  45.29 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  45.45 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  45.93 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  46.41 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  46.41 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  45.93 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  45.93 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  46.41 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  46.41 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  46.41 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  46.41 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  46.41 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  39.38 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  41.87 
 
 		 241 aa  157  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  42.48 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  38.14 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.74 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  41.01 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  41.48 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  40.71 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40.28 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  37.61 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40.28 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  37.61 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  40.18 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  37.95 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.72 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  37.05 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  38.36 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  40.74 
 
 		 377 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  38.57 
 
 		 385 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  40.37 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  39.34 
 
 		 383 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  38.57 
 
 		 383 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  39.73 
 
 		 240 aa  138  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  37.74 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  35.19 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  38.53 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  36.56 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  36.16 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  35.17 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  36.92 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  36.84 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  38.68 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  36.84 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  38.16 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  36.36 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  36.13 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  34.42 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0492  ribonuclease III  35.98 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.863648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  37.86 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  37.44 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  37.86 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  33.04 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  34.38 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  35.52 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  34.84 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  35.32 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  35.98 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  36.12 
 
 		 230 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  34.39 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  37.27 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  36.73 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  35.91 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  38.17 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  34.45 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  36.24 
 
 		 246 aa  121  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  36.77 
 
 		 239 aa  121  9e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  39.89 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  35.21 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  40.7 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  36.84 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  37.04 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  33.03 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  35.78 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  39.3 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  33.65 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  35.27 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  35.59 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  30.47 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  35.94 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  35.94 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  35.24 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  35.87 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  34.29 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  35.62 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  34.26 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  34.82 
 
 		 242 aa  115  8.999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  33.18 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  32.61 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  35.85 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  31.6 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  33.94 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>