More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05680 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  100 
 
 		 279 aa  569  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  76.52 
 
 		 281 aa  357  9.999999999999999e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  74.32 
 
 		 300 aa  348  7e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  52.47 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  36.16 
 
 		 226 aa  156  4e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  39.13 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  39.62 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  35.56 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  38.1 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  35.29 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  41.18 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  36.68 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  36.49 
 
 		 232 aa  145  8.000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  40.93 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  37.61 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  41.67 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  37.96 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  37.95 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  37.39 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  34.85 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  36 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  38.53 
 
 		 221 aa  140  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  37.61 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  39.63 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  37.17 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  38.5 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  37.07 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  34.63 
 
 		 245 aa  138  8.999999999999999e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  37.07 
 
 		 241 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  37.67 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  38.22 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  34.68 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  39.23 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  34.2 
 
 		 233 aa  136  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  34.22 
 
 		 238 aa  135  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  37.2 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  37.55 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  37.55 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  37.55 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  37.55 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  37.55 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  37.55 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  37.55 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  36.68 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  37.55 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  38.81 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  37.55 
 
 		 245 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  38.99 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  37.78 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  40.09 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  35.53 
 
 		 227 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  39.45 
 
 		 272 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  37.44 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  34.38 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  37.67 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  38.36 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  37.44 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  38.46 
 
 		 226 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  34.5 
 
 		 226 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  36.92 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  39.19 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  34.39 
 
 		 225 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  34.05 
 
 		 240 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  36.68 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  34.2 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  35.56 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  37.74 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  35.62 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  39.01 
 
 		 226 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  39.37 
 
 		 221 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  37.66 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  34.67 
 
 		 225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  34.78 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  36.32 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  34.6 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  40.65 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  38.07 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  38.81 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  35.38 
 
 		 230 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  32.17 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  32.17 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  34.82 
 
 		 227 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  36.32 
 
 		 227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  34.82 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  34.82 
 
 		 225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  34.68 
 
 		 232 aa  126  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  35.78 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  37.38 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  33.33 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  34.22 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  33.63 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  36.7 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  34.98 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  37.38 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  31.53 
 
 		 226 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  34.93 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  35.24 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  37.55 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  36.32 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  35.24 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>