More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1852 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  100 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  51.82 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  52.51 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  43.11 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  47.89 
 
 		 368 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  47.73 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  51.15 
 
 		 244 aa  187  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  49.09 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  48.36 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  50.23 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  47.53 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  48.65 
 
 		 256 aa  185  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  47.25 
 
 		 271 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  42.52 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  47.64 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  46.95 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  46.85 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  46.85 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  46.7 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  42.25 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  47.3 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  47.78 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  45.75 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  45.75 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  49.21 
 
 		 266 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  44.39 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  47.89 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  44.71 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  46.6 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  43.87 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  44.71 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  44.23 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  43.24 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  45.74 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  44.23 
 
 		 234 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  46.08 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  44.6 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  41.94 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  42.41 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  42.25 
 
 		 234 aa  158  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  44.55 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  43.18 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  44.29 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  41.96 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1743  ribonuclease III  46.64 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00285294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  44.29 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  43.52 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  43.58 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  42.73 
 
 		 233 aa  154  7e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  44.04 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  42.06 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  43.12 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  42.4 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  46.67 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  42.31 
 
 		 242 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  43.42 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1196  ribonuclease III  43.54 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0711323  decreased coverage  0.00493903 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  41.01 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  43.58 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  41.41 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  42.92 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  38.07 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  37.5 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  43.46 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0374  ribonuclease III  37.44 
 
 		 259 aa  148  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.7646  hitchhiker  0.000724257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0650  ribonuclease III  43.37 
 
 		 248 aa  148  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.397443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1402  ribonuclease III  43.69 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  43.13 
 
 		 263 aa  148  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  42.4 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  42.51 
 
 		 238 aa  147  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  42.2 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  42.2 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  37.39 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  43.9 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0333  ribonuclease III  38.29 
 
 		 265 aa  145  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.283295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  41.26 
 
 		 226 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  37.33 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  37.39 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  42.01 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0367  ribonuclease III  38.29 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  43.84 
 
 		 256 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  40.93 
 
 		 233 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  43.3 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  38.01 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  43.3 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  40.81 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  40.81 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  45.23 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  40.81 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  41.4 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  39.46 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  40 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  43.85 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  40 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0841  ribonuclease III  43.75 
 
 		 441 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  42.93 
 
 		 248 aa  142  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  42.93 
 
 		 248 aa  142  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  40.09 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  38.39 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1085  ribonuclease III  43.68 
 
 		 428 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>