More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0473 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  62.34 
 
 		 234 aa  295  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  63.39 
 
 		 257 aa  295  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  63.39 
 
 		 245 aa  295  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  56.62 
 
 		 239 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  56.62 
 
 		 239 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  52.97 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  52.73 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  51.53 
 
 		 238 aa  234  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  45.98 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  46.36 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  45.25 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  46.26 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  46.05 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  45.62 
 
 		 368 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  44.81 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  43.67 
 
 		 259 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  43.95 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  42.99 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  43.04 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  43.04 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  43.22 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  42.03 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  43.75 
 
 		 241 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  43.23 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  45.58 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  41.63 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  45.58 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  42.21 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  42.21 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  42.86 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  42.01 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  38.84 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  36.99 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  36.44 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  43.66 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  41.89 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  41.01 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  39.29 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  35.53 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  38.5 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  39.53 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  38.92 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  37.89 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  37.61 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.56 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  40.45 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  40.87 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  38.03 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  40.55 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  38.68 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  37.56 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  37.73 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  38.63 
 
 		 249 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  37.73 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  37.68 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  38.81 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  38.01 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  37.73 
 
 		 224 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  39.21 
 
 		 246 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  40.54 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  37.61 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  36.32 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  38.01 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  36.32 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  32.3 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  37.27 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  39.27 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  34.04 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  36.82 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  36.82 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  36.82 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  39.52 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  37.9 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  36.36 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  36.36 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  35.4 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  36.36 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  36.36 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  38.91 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  36.36 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  38.91 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  36.36 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  34.63 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  37.33 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  35 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3149  ribonuclease III  38.12 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000776488  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  36.05 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  37.74 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1068  ribonuclease III  37.74 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  37.56 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  37.26 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  34.53 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  33.79 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  40.7 
 
 		 377 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  38.03 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1196  ribonuclease III  36.41 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0711323  decreased coverage  0.00493903 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  34.08 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0281  ribonuclease III  37.02 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  35.06 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>