More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0522 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  100 
 
 		 227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  69.16 
 
 		 229 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  69.16 
 
 		 229 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  68.22 
 
 		 229 aa  287  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  67.14 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  65.71 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  62.22 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  55.09 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  50.71 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  52.11 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  50.47 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  49.32 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  50.93 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  47.93 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  47.98 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  46.82 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  46.58 
 
 		 256 aa  184  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  46.58 
 
 		 256 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  48.58 
 
 		 368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  44.95 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  48.45 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  45.83 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  44.29 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  44.29 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  43.81 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  43.52 
 
 		 244 aa  175  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  47.3 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  49 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  42.03 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  45.54 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  49 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  45.67 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  43.84 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  43.93 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  44.75 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  42.79 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  42.79 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  43.93 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  34.65 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  44.5 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  43.44 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  37.96 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  43.44 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  43.11 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  41.55 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  38.79 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  41.36 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  40.83 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  40.83 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  40.38 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  36.62 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  42.59 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  42.08 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  41.06 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  42.34 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  38.32 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  38.39 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  38.05 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  39.39 
 
 		 246 aa  148  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  36.07 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2975  ribonuclease III  44.24 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00170504  hitchhiker  0.00754361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  36.09 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  40.74 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  41.28 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  37.38 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  34.42 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  36.36 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  39.35 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  35 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  41.01 
 
 		 228 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  40.38 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3238  ribonuclease III  40.42 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.257375  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  39.73 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  40 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  38.01 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  40 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  38.5 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  38.12 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1737  ribonuclease III  50.27 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1196  ribonuclease III  44.39 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0711323  decreased coverage  0.00493903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  42.78 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  42.78 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  37.13 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  37.5 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  33.79 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  38.74 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  36.32 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  37.39 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  37.5 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  37.39 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  38.94 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  38.5 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  38.16 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  40.99 
 
 		 240 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  39.91 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  42.71 
 
 		 249 aa  138  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  37.21 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  37.18 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  37.5 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  39.07 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>