More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1151 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  99.16 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  75.95 
 
 		 238 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  70.71 
 
 		 239 aa  355  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  61.82 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  61.82 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  60.81 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  56.62 
 
 		 235 aa  251  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  54.21 
 
 		 238 aa  228  9e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  46.58 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  47.16 
 
 		 271 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  47.49 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  47.73 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  47.69 
 
 		 368 aa  188  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  47.49 
 
 		 259 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  47.56 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  46.61 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  46.61 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  45.98 
 
 		 244 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  46.15 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  45.18 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  45.91 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  43.75 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  45.85 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  44.83 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  44.83 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  44.55 
 
 		 229 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  44.55 
 
 		 229 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  43.89 
 
 		 241 aa  168  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  45.81 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  40.79 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  42.79 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  42.66 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  45.41 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  41.59 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  38.21 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  47.03 
 
 		 229 aa  144  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  40.47 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  44.77 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  40 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1737  ribonuclease III  48 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  41.98 
 
 		 234 aa  141  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  39.8 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  40.37 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  36.11 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  35.91 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  39.73 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  38.53 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  40.18 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  40.62 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  38.71 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  38.71 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  36.89 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  41.36 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  37.22 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  37.89 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  37.16 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  37.44 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  36.49 
 
 		 225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  35.45 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  39.63 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  40.09 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  37.74 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  34.2 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  38.39 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  37.74 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  36.53 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  37.74 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  37.56 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  37.84 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  37.56 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  38.07 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  37.27 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  37.9 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  37.56 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  37.99 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  35.62 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  36.11 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  40.29 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  44.44 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  40.43 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  36.36 
 
 		 236 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  37.26 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  35.78 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  36.49 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  37.26 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  37.26 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  38.5 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  36.65 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  38.64 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  36.79 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1743  ribonuclease III  39.63 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00285294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  37.05 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  36.79 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  36.48 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  37.74 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  36.79 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  36.79 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  41.15 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  36.79 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>