More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3455 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  100 
 
 		 259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  73.78 
 
 		 256 aa  326  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  73.78 
 
 		 256 aa  325  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  73.33 
 
 		 256 aa  324  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  69.37 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  66.95 
 
 		 244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  50.2 
 
 		 271 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  53.64 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  54.05 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  49.58 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  53.85 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  51.75 
 
 		 368 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  50.22 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  49.55 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  52.63 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  52.63 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  49.78 
 
 		 226 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  51.57 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  47.96 
 
 		 245 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  47.96 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  52.51 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  47 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  46.67 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  47.49 
 
 		 239 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  47.49 
 
 		 239 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  48.23 
 
 		 241 aa  188  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  50.48 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  50 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  50 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  46.82 
 
 		 227 aa  185  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  46.25 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  43.67 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  45.29 
 
 		 239 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  43.24 
 
 		 225 aa  175  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  47 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  42.06 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  48.69 
 
 		 229 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  44.7 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  40.61 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  45.89 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  45.97 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  41.59 
 
 		 225 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  41.15 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  42.92 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  43.38 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  40.62 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  43.26 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  47.73 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  43.84 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  40.62 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  40.18 
 
 		 226 aa  162  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  44.55 
 
 		 222 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  45.12 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02461  ribonuclease III  42.03 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1101  Ribonuclease III  42.03 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0115033  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  41.98 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2853  ribonuclease III  42.03 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0190873  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2720  ribonuclease III  42.03 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0115218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  42.4 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3803  ribonuclease III  42.03 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  40.62 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  40.18 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2722  ribonuclease III  42.03 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.444526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02425  hypothetical protein  42.03 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  43.38 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2932  ribonuclease III  42.03 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.223981  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1110  ribonuclease III  42.03 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1068  ribonuclease III  41.55 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  43.46 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  43.38 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  40.18 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2784  ribonuclease III  41.06 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2743  ribonuclease III  41.06 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2847  ribonuclease III  41.06 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0152776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2824  ribonuclease III  41.06 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2959  ribonuclease III  41.06 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  45.19 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  40.18 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  43.48 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  40.37 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3054  ribonuclease III  41.06 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255199  hitchhiker  0.00979275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  41.55 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  43.23 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  39.73 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  39.73 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  43.12 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  39.73 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  43.24 
 
 		 227 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  45.77 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  42.51 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3071  ribonuclease III  41.06 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  41.7 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  42.27 
 
 		 233 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  39.29 
 
 		 226 aa  155  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  42.79 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  43.05 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1204  ribonuclease III  41.55 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.401784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  40.27 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  42.79 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  40.27 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>