More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6614 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  100 
 
 		 244 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  85.25 
 
 		 244 aa  384  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  67.97 
 
 		 259 aa  293  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  67.25 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  67.25 
 
 		 256 aa  292  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  65.5 
 
 		 256 aa  284  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  54.82 
 
 		 235 aa  225  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  54.95 
 
 		 235 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  52.04 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  49.37 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  53.42 
 
 		 368 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  52.53 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  49.77 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  49.32 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  51.14 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  48.68 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  49.13 
 
 		 266 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  49.13 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  50.72 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  50.72 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  52.05 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  50.24 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  46.67 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  46.67 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  52.68 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  45.83 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  47.56 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  47.11 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  44.39 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  42.99 
 
 		 235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  46.22 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  44.95 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  45.85 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  46.4 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  44.98 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  45.33 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  41.67 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  42.33 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  41.26 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1196  ribonuclease III  43.93 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0711323  decreased coverage  0.00493903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  40.41 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  41.12 
 
 		 227 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0841  ribonuclease III  46.8 
 
 		 441 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  40 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  40 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1068  ribonuclease III  40.78 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  42.45 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02461  ribonuclease III  40.29 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1101  Ribonuclease III  40.29 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0115033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02425  hypothetical protein  40.29 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2853  ribonuclease III  40.29 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0190873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  41.75 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1402  ribonuclease III  43.11 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1110  ribonuclease III  40.29 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2722  ribonuclease III  40.29 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.444526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  44.91 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2932  ribonuclease III  40.29 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.223981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  45.71 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2720  ribonuclease III  40.29 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0115218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3803  ribonuclease III  40.29 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  42.51 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  44.85 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  39.45 
 
 		 226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  44.85 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3071  ribonuclease III  40.78 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  36.07 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  43.2 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  41.94 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  42.47 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2784  ribonuclease III  39.32 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2743  ribonuclease III  39.32 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2959  ribonuclease III  39.32 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2824  ribonuclease III  39.32 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2847  ribonuclease III  39.32 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0152776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  41.26 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  40.18 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1204  ribonuclease III  40.78 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.401784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3054  ribonuclease III  39.81 
 
 		 226 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255199  hitchhiker  0.00979275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1085  ribonuclease III  45.55 
 
 		 428 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  39.73 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2899  ribonuclease III  44.83 
 
 		 418 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.560315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  39.53 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1743  ribonuclease III  42.66 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00285294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  40.64 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  46.51 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4246  ribonuclease III  45.32 
 
 		 408 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  40.78 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  40.78 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2170  ribonuclease III  45.32 
 
 		 406 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290031  normal  0.408262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  43.66 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0374  ribonuclease III  39.37 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.7646  hitchhiker  0.000724257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  40.78 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1730  ribonuclease III  44.83 
 
 		 469 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2779  ribonuclease III  44.83 
 
 		 467 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2815  ribonuclease III  44.83 
 
 		 467 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0543  ribonuclease III  44.83 
 
 		 467 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  40.29 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2840  ribonuclease III  44.83 
 
 		 467 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1789  ribonuclease III  44.83 
 
 		 467 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2466  ribonuclease III  44.83 
 
 		 467 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>