More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2874 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  51.82 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  55.09 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  49.78 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  50 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  51.14 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  48.17 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  48.17 
 
 		 257 aa  198  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  52.91 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  52.43 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  52.43 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  45.98 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  49.77 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  46.93 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  47.73 
 
 		 239 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  47.73 
 
 		 239 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  52.48 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  45.74 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  46.15 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  47.03 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  48.87 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  46.61 
 
 		 256 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  46.61 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  53.54 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  45.91 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  47.47 
 
 		 368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  46.79 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  47 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  44.81 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  48.53 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  46.64 
 
 		 236 aa  175  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  43.66 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  44.44 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  46.43 
 
 		 221 aa  174  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  44.34 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  49.47 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  46.26 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  40.53 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  42.72 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  47.92 
 
 		 266 aa  165  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  48.44 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  42.45 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  42.45 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  42.33 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  43.98 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  43.18 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  41.86 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  41.26 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  41.26 
 
 		 233 aa  158  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  42.25 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  45.73 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  41.12 
 
 		 266 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  40.57 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  42.38 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  38.05 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  40.99 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  40.77 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  44.65 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  42.01 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  40.85 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  40.29 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  41.9 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  37.67 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  41.67 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  41.7 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.22 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  42.03 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  39.81 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1737  ribonuclease III  48.54 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  40.97 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  38.5 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  40.87 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  39.72 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0650  ribonuclease III  43.5 
 
 		 248 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.397443 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  37.61 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  39.72 
 
 		 236 aa  144  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  40.85 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  39.29 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  40.74 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  45.54 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  39.19 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1068  ribonuclease III  39.53 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  41.18 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  42.52 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  39.72 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  42.4 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  39.82 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  39.25 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  40.65 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  40.74 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  39.25 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  38.53 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  38.07 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  38.6 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  39.25 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  41.86 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  43.33 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  36.7 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  40.74 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  40 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>