More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1213 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  100 
 
 		 226 aa  447  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  49.77 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  51.39 
 
 		 252 aa  199  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  50 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  44.1 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  47.52 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  45.05 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  45.54 
 
 		 245 aa  164  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  45.54 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  42.92 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  45.41 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  44.78 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  46.19 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  45.05 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  45.63 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  45.07 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  46.73 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  46.73 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  45.37 
 
 		 272 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  39.72 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  43.56 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  45.54 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  43.56 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  45.41 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  46.27 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  46.27 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  45.05 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  34.68 
 
 		 232 aa  147  9e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  44.34 
 
 		 272 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  46.77 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  43.33 
 
 		 368 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  44.6 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  37.5 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  42.86 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  43.38 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  43.72 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  41.92 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  43.72 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  41.85 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  46.54 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  42.63 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  45.15 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  35.71 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  34.63 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1737  ribonuclease III  43.27 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  33.63 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  37.16 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  39.71 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  34.38 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  38.77 
 
 		 228 aa  128  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  33.48 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  40.09 
 
 		 260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  35.22 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0333  ribonuclease III  35.16 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.283295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  36.92 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  34.91 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  36.92 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  36.1 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0367  ribonuclease III  35.16 
 
 		 265 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  36.71 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  34.72 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  34.08 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  34.08 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  39.51 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  36.82 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  34.72 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  34.95 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  35.78 
 
 		 271 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  37.61 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  34.67 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  37.62 
 
 		 229 aa  121  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2975  ribonuclease III  39.17 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00170504  hitchhiker  0.00754361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  38.12 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  38.12 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  33.33 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3149  ribonuclease III  37.32 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000776488  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  35.35 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  34.84 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1947  ribonuclease III  41.42 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  35.35 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  31.56 
 
 		 245 aa  118  6e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  35.65 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  33.78 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  31.56 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  38.19 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  36.19 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  38.19 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  37.69 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  33.95 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  34.74 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  40.41 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0281  ribonuclease III  38.31 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0374  ribonuclease III  30.91 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.7646  hitchhiker  0.000724257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  36.45 
 
 		 246 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  35.19 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  34.26 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  34.68 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  35.5 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  34.36 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  33.33 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>