More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0991 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  69.7 
 
 		 235 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  56.14 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  53.98 
 
 		 271 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  53.46 
 
 		 368 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  52.89 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  53.12 
 
 		 272 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  52.7 
 
 		 272 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  54.05 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  53.81 
 
 		 266 aa  224  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  52.91 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  54.95 
 
 		 244 aa  215  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  53.15 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  52.25 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  52.91 
 
 		 256 aa  207  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  52.47 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  49.09 
 
 		 221 aa  191  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  48.42 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  45.74 
 
 		 238 aa  187  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  49.52 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  46.73 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  46.26 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  46.26 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  45 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  46.4 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  44.4 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  43.36 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  43.36 
 
 		 257 aa  174  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  46.61 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  46.26 
 
 		 226 aa  174  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  43.3 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  43.75 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  47.44 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  42.01 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  44.88 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  43.33 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  44.24 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  38.81 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  46.67 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  41.63 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  43.18 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  35.62 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  42.79 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  38.99 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  39.37 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  38.99 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  42.18 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  38.12 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  39.01 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1068  ribonuclease III  39.59 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  39.59 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  38.99 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  40.71 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  40.71 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  39.25 
 
 		 256 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  39.25 
 
 		 256 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3071  ribonuclease III  38.38 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  38.53 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  33.03 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  41.86 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1204  ribonuclease III  38.38 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.401784  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2784  ribonuclease III  38.58 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  39.25 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  44.21 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  38.63 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2743  ribonuclease III  38.58 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2824  ribonuclease III  38.58 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2847  ribonuclease III  38.58 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0152776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2959  ribonuclease III  38.58 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3054  ribonuclease III  38.58 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255199  hitchhiker  0.00979275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02461  ribonuclease III  38.07 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1101  Ribonuclease III  38.07 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0115033  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  37.9 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  37.9 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2720  ribonuclease III  38.07 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0115218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1110  ribonuclease III  38.07 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3803  ribonuclease III  38.07 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2853  ribonuclease III  38.07 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0190873  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  39.25 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2722  ribonuclease III  38.07 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.444526  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  40.09 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02425  hypothetical protein  38.07 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2932  ribonuclease III  38.07 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.223981  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  38.25 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  36.24 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  37.9 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1402  ribonuclease III  40.09 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  40.2 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  40.2 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  42.02 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  39.69 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0650  ribonuclease III  41.67 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.397443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  36.82 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  38.03 
 
 		 233 aa  135  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  39.9 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  37.04 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  36 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  38.62 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  38.03 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  38.03 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>