More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1054 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  100 
 
 		 226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  83.63 
 
 		 226 aa  401  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  53.39 
 
 		 232 aa  241  7e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  44 
 
 		 222 aa  194  6e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  42.25 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  42.72 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  40.27 
 
 		 271 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  39.55 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  39.65 
 
 		 235 aa  161  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  41.96 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  38.92 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  41.4 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  41.2 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  39.55 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  38.07 
 
 		 272 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  40 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  37.67 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  37.96 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  38.97 
 
 		 368 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  39.17 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  39.9 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  39.9 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  39.9 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  38.53 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  38.53 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  38.53 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  40.47 
 
 		 221 aa  155  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  36.52 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  38.53 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  38.01 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  38.53 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  38.53 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  38.53 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  38.53 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  38.67 
 
 		 266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  39.11 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  37.17 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  39.11 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  40.09 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  37.16 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  40.09 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  37.61 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  39.64 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  37.95 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  37.95 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  36.56 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  36.56 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  38.64 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  39.27 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  38.5 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  40.76 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  39.6 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  35.53 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  38.5 
 
 		 225 aa  148  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  36.56 
 
 		 256 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  36.32 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  34.7 
 
 		 259 aa  148  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  37.74 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.07 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  37 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  38.86 
 
 		 257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  37.98 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  38.57 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  37.74 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  42 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  37.61 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  37.5 
 
 		 234 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  35.62 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  38.12 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  36.32 
 
 		 282 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  35.62 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  38.46 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  36.53 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  44.88 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  39.2 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  35.78 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  41.4 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  37.22 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  40.29 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  37.75 
 
 		 266 aa  142  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  36.49 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  36.27 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1243  ribonuclease III  38.66 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000271922  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  36.92 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  36.49 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  36.92 
 
 		 227 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  35.11 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  36.73 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  35.32 
 
 		 238 aa  141  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  39.61 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  40.65 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  35.48 
 
 		 234 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  36 
 
 		 279 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  36.89 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  35.91 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0374  ribonuclease III  38.67 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.7646  hitchhiker  0.000724257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  36.89 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3149  ribonuclease III  39.45 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000776488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  35.94 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  36.16 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>