More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0374 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0374  ribonuclease III  100 
 
 		 259 aa  533  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.7646  hitchhiker  0.000724257 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0333  ribonuclease III  74.11 
 
 		 265 aa  350  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.283295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0367  ribonuclease III  73.66 
 
 		 265 aa  349  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  48.65 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  48.43 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  50.68 
 
 		 226 aa  205  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  49.77 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  49.08 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  47.96 
 
 		 226 aa  198  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  45.5 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  47.71 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  48.18 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  48.17 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  46.64 
 
 		 226 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  47.27 
 
 		 226 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  48.56 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  46.82 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  46.82 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  46.36 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  45.65 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  46.36 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  46.36 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  46.82 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  46.82 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  49.04 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  46.19 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  46.79 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  45.98 
 
 		 226 aa  188  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2959  ribonuclease III  47.55 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  45.22 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2824  ribonuclease III  47.55 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2847  ribonuclease III  47.55 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0152776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2784  ribonuclease III  47.55 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2743  ribonuclease III  47.55 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02461  ribonuclease III  47.55 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1101  Ribonuclease III  47.55 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0115033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02425  hypothetical protein  47.55 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1110  ribonuclease III  47.55 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2853  ribonuclease III  47.55 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0190873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2722  ribonuclease III  47.55 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.444526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3803  ribonuclease III  47.55 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2720  ribonuclease III  47.55 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0115218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2932  ribonuclease III  47.55 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.223981  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  48.08 
 
 		 229 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3054  ribonuclease III  47.06 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255199  hitchhiker  0.00979275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1068  ribonuclease III  47.55 
 
 		 226 aa  185  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  44.84 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  47.6 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  46.85 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  45.66 
 
 		 230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  47.06 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  49.52 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  47.66 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  46.23 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  47.2 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3071  ribonuclease III  46.57 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  47.2 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  46.23 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  47.12 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  47.03 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3149  ribonuclease III  46.15 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000776488  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  47.39 
 
 		 229 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  47.66 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1204  ribonuclease III  46.08 
 
 		 226 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.401784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  45.12 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3669  ribonuclease III  46.57 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  45.29 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  44.95 
 
 		 227 aa  175  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  45.13 
 
 		 225 aa  175  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0281  ribonuclease III  46.34 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3611  ribonuclease III  45.41 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  44.95 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1136  ribonuclease III  45.41 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0329439  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1189  ribonuclease III  45.41 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.17286  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  41.49 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  46.73 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  41.08 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  41.08 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2975  ribonuclease III  46.76 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00170504  hitchhiker  0.00754361 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  44.29 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  43.72 
 
 		 233 aa  168  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  43.89 
 
 		 222 aa  168  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  41.81 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0841  ribonuclease III  44.28 
 
 		 441 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1243  ribonuclease III  46.86 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000271922  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  44.09 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  41.28 
 
 		 224 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  41.28 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  40.64 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0413  ribonuclease III  45.59 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  40.68 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  43.9 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  43.9 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  47.12 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1402  ribonuclease III  45.54 
 
 		 228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.922239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  43.69 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2899  ribonuclease III  44.04 
 
 		 418 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.560315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  40.18 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2779  ribonuclease III  43.52 
 
 		 467 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1085  ribonuclease III  43.52 
 
 		 428 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>