More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0852 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  55.45 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  53.33 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  52.47 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  39.63 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  42.65 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.77 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  36.28 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  39.55 
 
 		 272 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  39.13 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  40.36 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  40.36 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  41.63 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  38.14 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  39.48 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  43.24 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  40.99 
 
 		 228 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  36.61 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  39.07 
 
 		 238 aa  148  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  40.91 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  38.25 
 
 		 237 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  32.89 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  32.89 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  40.18 
 
 		 221 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  37.85 
 
 		 236 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  38.18 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  37.9 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  40.64 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  40.64 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  37.9 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  38.03 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  37.39 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  38.36 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  36.84 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  37.72 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  39.04 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  37.61 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  38.14 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  36.92 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  35.55 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  36.41 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  39.15 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  36.41 
 
 		 248 aa  138  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  38.74 
 
 		 228 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  37.86 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  34.7 
 
 		 222 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  37.86 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  34.96 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  36.36 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  37.22 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  37.12 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  35.47 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  36.68 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  34.65 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  36.68 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  38.89 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  37.84 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  38.43 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  35.55 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  39.09 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  40.93 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  37.16 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  36.68 
 
 		 245 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  36.68 
 
 		 245 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  36.41 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  36.68 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  36.68 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  36.68 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  36.68 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  36.68 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  39.09 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  36.54 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  37.39 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  36.24 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  37.96 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  37.8 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  39.15 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  36.36 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  36.24 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  36.65 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  36.65 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  36.68 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  36.92 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  38.16 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  34.55 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  36.23 
 
 		 282 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  36.68 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  35.81 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  38.01 
 
 		 228 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  32.16 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  39.73 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  39.2 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  37.34 
 
 		 377 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  40.38 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  38.57 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  36.71 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  36 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  36.99 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  35.65 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  38.69 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>