More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2495 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  100 
 
 		 273 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  66.54 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  63.53 
 
 		 273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  66.81 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  57.93 
 
 		 276 aa  291  7e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  56.39 
 
 		 271 aa  290  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0172  Ribonuclease III  51.16 
 
 		 277 aa  251  9.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  48.83 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  45.63 
 
 		 235 aa  165  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  43.66 
 
 		 246 aa  165  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.31 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  42.61 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  39.57 
 
 		 242 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  37.24 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  40.09 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  39.55 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  39.63 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  42.33 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  41.9 
 
 		 231 aa  152  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  37.38 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  42.51 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.76 
 
 		 236 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  40.91 
 
 		 236 aa  148  9e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  38.1 
 
 		 231 aa  148  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  41.62 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  38.16 
 
 		 236 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4194  ribonuclease III  40.09 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  41.26 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  41.84 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  38.5 
 
 		 243 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  38.5 
 
 		 243 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  38.76 
 
 		 245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  37.79 
 
 		 245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  43.35 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  42.13 
 
 		 385 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  40.62 
 
 		 234 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  37.27 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  39.52 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  37.44 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  37.05 
 
 		 377 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  39.17 
 
 		 233 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  38.5 
 
 		 229 aa  143  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  37.27 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  38.83 
 
 		 252 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  36.89 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  41.33 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  38.46 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  41.75 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5150  ribonuclease III  38.92 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0990083  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  37.22 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  39.91 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  34.96 
 
 		 223 aa  139  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  40 
 
 		 249 aa  138  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  38.35 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  37.44 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  37.32 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  36.92 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  37.8 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  36.62 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  39.44 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  37.86 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  39.38 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3916  ribonuclease III  35.65 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  34.26 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  38.28 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  34.26 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  35.68 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  37.56 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  39.07 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  38.18 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  37.91 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  39.49 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  39.59 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  39.13 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  39.7 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  36.15 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  38.27 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  37.62 
 
 		 238 aa  132  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  39.59 
 
 		 229 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  36.41 
 
 		 231 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  37.27 
 
 		 271 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  36.19 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  36.92 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  37.79 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  39.9 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  38.94 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  38.46 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1714  Ribonuclease III  37.38 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.61541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  36.19 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  37.19 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  38.83 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  35.65 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1206  hypothetical protein  35.78 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000396494 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  36.77 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  36.92 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  39.9 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  41.06 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  37.8 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  39.59 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  37.33 
 
 		 226 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>