More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0128 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  58.27 
 
 		 273 aa  301  5.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  56.87 
 
 		 273 aa  291  5e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  57.93 
 
 		 273 aa  291  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  57.68 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  57.08 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0172  Ribonuclease III  51.94 
 
 		 277 aa  256  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  48.1 
 
 		 260 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  43.56 
 
 		 246 aa  159  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  45.75 
 
 		 246 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  40.09 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  42.79 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  39.66 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  41.55 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  44.71 
 
 		 235 aa  149  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.27 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  38.71 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  38.71 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  40.17 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  42.03 
 
 		 242 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  41.4 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  41.84 
 
 		 383 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  42.05 
 
 		 383 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  40 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  39.55 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  37.32 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  42.21 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  37.62 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  40.28 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  40.19 
 
 		 233 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  41.33 
 
 		 385 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  39.27 
 
 		 240 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  39.17 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  37.84 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  36.73 
 
 		 232 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  41.98 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  40 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  39.81 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  37.5 
 
 		 237 aa  135  9e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  36.11 
 
 		 234 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.72 
 
 		 246 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  40.17 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  39.63 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  39.62 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  36.67 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  40.87 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  39.35 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  36.53 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  42.34 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  40.87 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4194  ribonuclease III  41.12 
 
 		 242 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  41.44 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  37.56 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  40.38 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  36.73 
 
 		 238 aa  132  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  39.55 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  41.59 
 
 		 228 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  38.21 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  37.1 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  37.02 
 
 		 245 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  39.9 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  37.61 
 
 		 223 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  39.91 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  39.35 
 
 		 230 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  36.2 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  35.51 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  39.6 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  35.51 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  40.19 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  39.6 
 
 		 229 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  37.86 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  37.75 
 
 		 228 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  37.78 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  36.87 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  36.87 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  36.87 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  38.84 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  40.19 
 
 		 225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  36.87 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  38.1 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  39.81 
 
 		 228 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  37.33 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  37.16 
 
 		 228 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  35.98 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  38.36 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  36.87 
 
 		 226 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  39.23 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  37.04 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3916  ribonuclease III  33.8 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  38.89 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  36.87 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  38.22 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  34.58 
 
 		 247 aa  125  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_002620  TC0570  ribonuclease III  36.89 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  37.5 
 
 		 226 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  37.79 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3854  ribonuclease III  40.41 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  36.41 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  35.32 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>