More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1659 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  67.39 
 
 		 273 aa  305  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  66.81 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  62.17 
 
 		 273 aa  270  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  57.08 
 
 		 276 aa  259  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  55.17 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0172  Ribonuclease III  52.97 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  48.6 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  44.19 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  41.1 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  39.65 
 
 		 377 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  43.59 
 
 		 385 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  40.44 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  40.27 
 
 		 383 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  40.27 
 
 		 383 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  42.86 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  41.41 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  38.72 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  40.83 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.43 
 
 		 236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  36.64 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  39.04 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  41.23 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.09 
 
 		 236 aa  142  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  39.83 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  41.41 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  38.68 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  38.46 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  38.03 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  38.03 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  38.03 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  38.03 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  38.03 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  38.03 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  38.03 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  38.03 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  40.93 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  39.48 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5150  ribonuclease III  38.34 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0990083  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  38.79 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  38.18 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  37.9 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1010  ribonuclease III  39.48 
 
 		 425 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  38.18 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4194  ribonuclease III  38.46 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.21 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  36.44 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1014  ribonuclease III  39.48 
 
 		 425 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  39.62 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  37.56 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  37.56 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  37.02 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  33.76 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  39.42 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  36.84 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4246  ribonuclease III  39.06 
 
 		 408 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  38.82 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1730  ribonuclease III  39.64 
 
 		 469 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2170  ribonuclease III  39.64 
 
 		 406 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290031  normal  0.408262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3916  ribonuclease III  35.35 
 
 		 248 aa  134  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1092  ribonuclease III  39.06 
 
 		 409 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2779  ribonuclease III  39.64 
 
 		 467 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0543  ribonuclease III  39.64 
 
 		 467 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.610514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  37.5 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2466  ribonuclease III  39.64 
 
 		 467 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2895  ribonuclease III  39.64 
 
 		 467 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1789  ribonuclease III  39.64 
 
 		 467 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2840  ribonuclease III  39.64 
 
 		 467 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0654  ribonuclease III  39.06 
 
 		 409 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.988138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2815  ribonuclease III  39.64 
 
 		 467 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1134  ribonuclease III  39.06 
 
 		 409 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  36.96 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  37.56 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  36.48 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  39.91 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  37.07 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  42.52 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  41.67 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  38.16 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  38.18 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  34.84 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  34.84 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  36.48 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  38.03 
 
 		 256 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  37.33 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  38.05 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  37.83 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  40.55 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  39.37 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  40.55 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  41.62 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  37.67 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  36.52 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  37.61 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  37.14 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  39.34 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  39.32 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  35.16 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  35.4 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  35.45 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>