More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5150 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5150  ribonuclease III  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0990083  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3916  ribonuclease III  68.83 
 
 		 248 aa  359  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  49.16 
 
 		 247 aa  232  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4194  ribonuclease III  51.07 
 
 		 242 aa  224  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1206  hypothetical protein  48.46 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000396494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0361  ribonuclease III  43.86 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  39.55 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  39.83 
 
 		 271 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  42.01 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  36.65 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1763  ribonuclease III  37.84 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  39.37 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  38.46 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1139  ribonuclease III  38.36 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  36.14 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0172  Ribonuclease III  36.82 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  40.58 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  40 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  37.67 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  35.22 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  35.43 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  38.58 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  35.43 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1321  ribonuclease III  36.24 
 
 		 252 aa  128  7.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  36.4 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  38.21 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  39.71 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  34.35 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03140  putative ribonuclease III  33.82 
 
 		 247 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.956327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  35.24 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  35.24 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  35.37 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  38.14 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  36.24 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  34.6 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  36.76 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  36.44 
 
 		 236 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  33.19 
 
 		 300 aa  118  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  37.1 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  37.09 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  35.16 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  36.65 
 
 		 248 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  37.68 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  39.27 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  36.8 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  34.39 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  35.43 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0333  ribonuclease III  36.07 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.283295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  37.31 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  34.7 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  39.44 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  39.44 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  39.44 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  39.44 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  39.44 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  35.38 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0367  ribonuclease III  36.07 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  36.62 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  38.89 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  38.89 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  39.44 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  38.89 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  35.14 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  39.44 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  39.5 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  36.1 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  37.62 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  39.66 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  36.53 
 
 		 229 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  35.48 
 
 		 245 aa  111  9e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  37.13 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  38.51 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  36.53 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  36.56 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  34.7 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  35.68 
 
 		 222 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  32.57 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  37.1 
 
 		 228 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  32.89 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  37.78 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  35.92 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  33.8 
 
 		 230 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  35.92 
 
 		 227 aa  109  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  38.55 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  35.35 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  37.63 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  38.17 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  33.48 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  38.17 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  32.57 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  34.02 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  35.81 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  32.9 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  36.79 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  38.17 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  35.38 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  33.48 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  32.9 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  37.09 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  37.44 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>