More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03140 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03140  putative ribonuclease III  100 
 
 		 247 aa  503  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.956327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1139  ribonuclease III  67.76 
 
 		 246 aa  345  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1321  ribonuclease III  52.61 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  35.32 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4194  ribonuclease III  38.12 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0361  ribonuclease III  37.9 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3916  ribonuclease III  32.91 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1206  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000396494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  33.93 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5150  ribonuclease III  33.33 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0990083  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_002950  PG1763  ribonuclease III  33.04 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  34.73 
 
 		 271 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0172  Ribonuclease III  33.8 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  38.38 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  33.18 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  34.55 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  33.66 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  31.63 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  34.68 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  31.7 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  35.75 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  31.84 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  30.7 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  30.7 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  36.22 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  33.33 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  32.42 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  33.78 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  34.3 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  31.3 
 
 		 228 aa  99.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  31.82 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  31.51 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  32.11 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  31.47 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  30.67 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  34.74 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  32.74 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  30.94 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  32.29 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  31.63 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  32.02 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  33.91 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  31.78 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  31.65 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  30.87 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  30.49 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  29.24 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  29.82 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  29.25 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  29.95 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  31.73 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  32 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  30.84 
 
 		 222 aa  92.8  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  32.55 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  29.3 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  28.71 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  30.49 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  29.39 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  31.6 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  27.96 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  29.72 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  31.6 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  33.33 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  29.92 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  30.39 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  30.63 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  31.6 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  32.42 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  33.33 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  33.66 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  31.6 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  31.6 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  33.79 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  32.87 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  31.6 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  31.6 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  30.69 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  32.52 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  31.6 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  31.13 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  27.27 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  30.43 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  31.6 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  27.27 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  30.1 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  29.78 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  30.52 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  32.42 
 
 		 246 aa  88.6  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  31.13 
 
 		 245 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  31.16 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  29.95 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  31.11 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  29.38 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  28.51 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  32.2 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  28.63 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  28.18 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0333  ribonuclease III  31.96 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.283295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  28.64 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  33.33 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>