More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1321 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1321  ribonuclease III  100 
 
 		 252 aa  519  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1139  ribonuclease III  52.84 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03140  putative ribonuclease III  52.61 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.956327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4194  ribonuclease III  43.56 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  39.36 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0361  ribonuclease III  41.38 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3916  ribonuclease III  36.24 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1763  ribonuclease III  36.61 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1206  hypothetical protein  36.44 
 
 		 241 aa  125  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000396494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  33.62 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5150  ribonuclease III  39.33 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0990083  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  33.48 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  33.04 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  33.91 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  31.47 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  32.46 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  33.63 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  35.44 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  33.63 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  31.25 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  31.73 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  33.18 
 
 		 276 aa  101  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  31.39 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  33.49 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  31.86 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  33.48 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  33.33 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  29.73 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  34.74 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  31.16 
 
 		 220 aa  99  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  31.28 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  31.86 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  32.37 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0172  Ribonuclease III  32.42 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  31.84 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  29.91 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  34.47 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  31.09 
 
 		 236 aa  95.5  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  33.18 
 
 		 231 aa  95.5  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  31.78 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  31.72 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  30.94 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  31.16 
 
 		 276 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  33.99 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  31.55 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  30.94 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  32.11 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  32.75 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  32.61 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  28.64 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  30.56 
 
 		 233 aa  92  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  31.71 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  31.11 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  31.58 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  30.81 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  28.9 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  31.25 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  32.09 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  30.81 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  31.58 
 
 		 368 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  33.64 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  29.7 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  29.55 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  28.44 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  33.18 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  31.36 
 
 		 245 aa  89.4  6e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  33.18 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0333  ribonuclease III  30.26 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.283295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  31.48 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  33.18 
 
 		 226 aa  88.6  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  32.07 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  28.57 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  31.23 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0492  ribonuclease III  30.95 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.863648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  29.57 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0367  ribonuclease III  30.26 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  32.27 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  31.11 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  29.65 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  29.56 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  32.91 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  32 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  29.65 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  31.36 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0598  Ribonuclease III  29.86 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  30.47 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  31.88 
 
 		 225 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  29.36 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0196  ribonuclease III  32 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.483846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  31.69 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  31.82 
 
 		 226 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  27.19 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  29.18 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  30.87 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  33.95 
 
 		 236 aa  85.5  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  32.61 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  29.69 
 
 		 241 aa  85.5  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  30.4 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  29.82 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0374  ribonuclease III  32.54 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.7646  hitchhiker  0.000724257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>