More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0598 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0598  Ribonuclease III  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  41.13 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  40.18 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.39 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  41.26 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  36.2 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  37.44 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  39.91 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  39.64 
 
 		 246 aa  134  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  40.27 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  38.79 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  37.39 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  37.02 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  39.34 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  36.04 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  36.04 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  35 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  38.39 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  35.4 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  38.39 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  38.97 
 
 		 236 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  38.39 
 
 		 245 aa  128  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  38.39 
 
 		 245 aa  128  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  34.56 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  38.57 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  38.57 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  38.57 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  38.57 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  37.17 
 
 		 233 aa  128  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  36.99 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  39.23 
 
 		 249 aa  128  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  38.39 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  37.91 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  34.5 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  36.41 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  37.61 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  35.11 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  37.98 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  36.24 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  34.98 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  36.65 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  34.98 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  35.14 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  37.5 
 
 		 240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  37.5 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  37.84 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  37.14 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  35.56 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  37.22 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  37.67 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  37.16 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  37.79 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  36.7 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  33.63 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  38.16 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  37.5 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  37.05 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  36.64 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  37.44 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  34.26 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  36.28 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  37.44 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  34.1 
 
 		 221 aa  121  9e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0570  ribonuclease III  36.61 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  38.05 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  34.7 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  38.05 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  39.51 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  36.77 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  36.59 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  37.8 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  37.91 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  38.25 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  37.09 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  37.33 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  36.57 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  36.28 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  33.19 
 
 		 233 aa  118  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  34.84 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  34.98 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  36.07 
 
 		 233 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  32.88 
 
 		 231 aa  118  9e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  36.28 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  36.7 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  37.73 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  35.65 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  37.85 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  33.33 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  33.19 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  36.45 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  35.65 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  35.29 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  37.16 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  36.99 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  35.02 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  38.31 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  39.71 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  35.02 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  33.49 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  36.28 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>