More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2990 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  45.85 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  41.52 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  38.72 
 
 		 233 aa  158  9e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  44.2 
 
 		 229 aa  158  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  40.93 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  43.56 
 
 		 230 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  44.35 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  45.13 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  44.35 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.38 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1073  ribonuclease III  45 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  45.95 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  38.94 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  37.5 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  43.84 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  42.42 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  39.53 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  42.61 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  41.74 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  41.99 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  40.17 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  41.48 
 
 		 243 aa  148  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  44.29 
 
 		 228 aa  148  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  41.3 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  43.38 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  38.05 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  43.44 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  42.73 
 
 		 377 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0994  ribonuclease III  44.04 
 
 		 229 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683034  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  44.8 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  40.97 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  42.04 
 
 		 246 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  38.22 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  43.69 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  39.04 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  38.94 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  43.58 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  43.58 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  41.77 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  41.78 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  41.74 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  41.51 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_002620  TC0570  ribonuclease III  40.53 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1243  ribonuclease III  42.93 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000271922  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  38.46 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  42.17 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  41.18 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  37.39 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  37.78 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  36.32 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  39.57 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  37.67 
 
 		 224 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  40.69 
 
 		 227 aa  138  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  41.63 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  35.86 
 
 		 236 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  39.73 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  39.15 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  38.39 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  37.78 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  37.55 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  38.39 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  43.67 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  36.65 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  38.5 
 
 		 226 aa  135  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  36.77 
 
 		 225 aa  135  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  38.25 
 
 		 226 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  37.78 
 
 		 231 aa  135  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  40.44 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  40.83 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  41.78 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  42.36 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  38.29 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  42.73 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  39.27 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  40.17 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  40.09 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  40.17 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  40.69 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  40.69 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  40.17 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  40.69 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  40.47 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  40.69 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  41.07 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  40 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  39.32 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  37.68 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  41.63 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  37.78 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  37.84 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  37.78 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  39.74 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  37.78 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  37.17 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  40.95 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  40.17 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  42.06 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  38.01 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  40.17 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>