More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3813 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  51.72 
 
 		 235 aa  224  9e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  50.42 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  53.74 
 
 		 233 aa  215  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  51.9 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  53.57 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  47.85 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  47.29 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  52.41 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  50.23 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  43.59 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  49.01 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  44.7 
 
 		 246 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  44.66 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  48.7 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  50 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  43.6 
 
 		 231 aa  175  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  42.52 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  43.46 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  44.8 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  47.75 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  46.5 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  44.56 
 
 		 223 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  43.96 
 
 		 245 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  43.78 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  48.04 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  43.78 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  45.87 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  47.52 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  45.36 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  45.36 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  46.67 
 
 		 385 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  43.6 
 
 		 229 aa  169  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  45.36 
 
 		 245 aa  168  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  39.15 
 
 		 233 aa  168  8e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  47.18 
 
 		 383 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  44.85 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  44.85 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  44.85 
 
 		 245 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  44.85 
 
 		 245 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  44.85 
 
 		 245 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  44.85 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  47.18 
 
 		 383 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  44.85 
 
 		 245 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  44.85 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  46.08 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  40.54 
 
 		 222 aa  166  5e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  42.93 
 
 		 223 aa  166  5e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  43 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  45.63 
 
 		 252 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  45.41 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  41.15 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  45.15 
 
 		 240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  44.02 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  41.15 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  42.67 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  44.5 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  43.2 
 
 		 232 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  41.48 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  46.39 
 
 		 276 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  44.65 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  43.61 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  42.58 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  45.85 
 
 		 276 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.41 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  38.89 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  41.59 
 
 		 227 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  40.95 
 
 		 225 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  40.95 
 
 		 225 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  40.95 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  37.27 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  47.49 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  49.25 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  41.15 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  42.52 
 
 		 225 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  42.71 
 
 		 240 aa  156  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  42.52 
 
 		 225 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  44.5 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  39.15 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  41.01 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  41.01 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  41.01 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  41.35 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  42.04 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  39.65 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  38.43 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  41.23 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  48.97 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  41.18 
 
 		 227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  41.33 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  45.71 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  38.43 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  43.63 
 
 		 240 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  41.63 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  45.71 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  45.21 
 
 		 306 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  46.53 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  40.1 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  40.37 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  44.23 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>