More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2065 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  66.06 
 
 		 224 aa  297  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  65.61 
 
 		 225 aa  295  3e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  65.61 
 
 		 225 aa  295  4e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  63.96 
 
 		 227 aa  285  4e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  65.45 
 
 		 222 aa  285  5e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  63.35 
 
 		 223 aa  280  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  61.09 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  59.62 
 
 		 223 aa  248  6e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  45.37 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  42.27 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  41.23 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  42.41 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  44.98 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  42.92 
 
 		 242 aa  174  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  45.33 
 
 		 246 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  40.38 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  38.5 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  40.28 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  43.44 
 
 		 377 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  42.33 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  38.86 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  40.54 
 
 		 246 aa  167  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  40.99 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  39.82 
 
 		 246 aa  165  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  39.19 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  40.09 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  41.52 
 
 		 242 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  40.09 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  39.82 
 
 		 259 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  38.57 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  40.55 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  39.21 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  38.57 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  40.79 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  38.01 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  42.65 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  42.65 
 
 		 383 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  42.18 
 
 		 385 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  45.13 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.27 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  36.89 
 
 		 246 aa  157  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  44.25 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  39.11 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  44.25 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  39.82 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  37.89 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  39.81 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  37.89 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  39.04 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  38.96 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  39.91 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  38.18 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  38.39 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  38.16 
 
 		 237 aa  154  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  37.79 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  37.72 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  43.81 
 
 		 245 aa  154  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  43.81 
 
 		 245 aa  154  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  43.81 
 
 		 245 aa  154  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  43.81 
 
 		 245 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  43.81 
 
 		 245 aa  154  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  43.81 
 
 		 245 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  36.87 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  43.81 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  38.18 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  37.38 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  39.3 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  42.92 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  37.89 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  36.61 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  36.84 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  38.01 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  36.4 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  36.53 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  36.94 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  36.87 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  40 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  36.16 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  37.56 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  37.33 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  37.9 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  39.39 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  37.12 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  37.39 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  39.09 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  37.55 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  37.99 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  38.77 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  37.05 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  37.12 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  37.12 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  38.29 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  39.91 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  36.4 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  36.61 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  38.01 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  36.99 
 
 		 233 aa  148  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  38.79 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  35.27 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>