More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1975 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  65.04 
 
 		 226 aa  296  2e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  63.96 
 
 		 223 aa  285  4e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  61.36 
 
 		 222 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  60.36 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  60.45 
 
 		 225 aa  271  7e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  60.45 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  59.45 
 
 		 223 aa  259  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  58.65 
 
 		 223 aa  248  7e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  43.17 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  44.54 
 
 		 246 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  40.61 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.3 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  45.61 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  43.89 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  42.79 
 
 		 377 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  44.1 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  42.99 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  43.12 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  42.45 
 
 		 383 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  39.82 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  41.98 
 
 		 385 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  42.45 
 
 		 383 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  40.17 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  38.5 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  40.09 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  44.4 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  41.41 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  41.26 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  40.18 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  43.35 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  43.35 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  43.35 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  43.35 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  44.49 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  44.49 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  43.35 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  44.49 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  44.49 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  43.1 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  41.78 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.17 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  40.99 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  39.81 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  40.27 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  38.74 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  41.1 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  42.86 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  39.63 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  41.85 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  41.1 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  39.63 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  39.17 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  39.73 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  37.17 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  40.45 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  38.91 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  40.45 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  40.28 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  41.18 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  40.37 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  40.35 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  40.38 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  38.26 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  41.15 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  40.79 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  38.05 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  39.3 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  37.83 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  38.64 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  43.63 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  34.35 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  40.89 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  38.6 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  38.79 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  37.83 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  38.29 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  41.15 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  38.77 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2252  ribonuclease III  40.53 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  42.41 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  38.53 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  38.25 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  36.12 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  35.37 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  37.84 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  37.22 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  38.76 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  38.39 
 
 		 233 aa  144  9e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  38.81 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  38.81 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  38.5 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  36.94 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  37.96 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  36.94 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  37.67 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  37.22 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  40.74 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  41.58 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2418  ribonuclease III  38.95 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.277213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>