More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1650 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  100 
 
 
385 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  82.95 
 
 
383 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  95.77 
 
 
383 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  74.23 
 
 
377 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  48.05 
 
 
242 aa  206  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  46.69 
 
 
246 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  44.64 
 
 
236 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  46.83 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  46.64 
 
 
246 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  46.43 
 
 
246 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  48.47 
 
 
240 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  44.84 
 
 
259 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  49.77 
 
 
235 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  49.32 
 
 
246 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  41.78 
 
 
236 aa  186  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  45.18 
 
 
226 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  47.72 
 
 
282 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  42.92 
 
 
230 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  43.89 
 
 
232 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  50.71 
 
 
246 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  42.92 
 
 
245 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  42.92 
 
 
245 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  42.92 
 
 
245 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  42.92 
 
 
245 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  41.23 
 
 
224 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  43.11 
 
 
245 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  43.11 
 
 
245 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  42.92 
 
 
245 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  43.11 
 
 
245 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  43.11 
 
 
245 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  42.79 
 
 
245 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40.09 
 
 
241 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40.54 
 
 
241 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  47.53 
 
 
243 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  36.84 
 
 
233 aa  177  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  41.83 
 
 
245 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  40.79 
 
 
225 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  47.44 
 
 
235 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  50 
 
 
240 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  40.79 
 
 
225 aa  176  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  46.6 
 
 
262 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  43.58 
 
 
231 aa  176  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  40.36 
 
 
222 aa  176  9e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  44.55 
 
 
223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  41.59 
 
 
229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  45.45 
 
 
233 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  46.67 
 
 
249 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  47.34 
 
 
241 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  43.17 
 
 
246 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  42.6 
 
 
236 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  42.04 
 
 
227 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  44.92 
 
 
248 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  41.13 
 
 
223 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  44.55 
 
 
228 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  44.78 
 
 
234 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  46.64 
 
 
276 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  41.41 
 
 
223 aa  168  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  45.54 
 
 
230 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  41.92 
 
 
239 aa  167  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  50 
 
 
232 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  45.95 
 
 
240 aa  166  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  45.02 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  41.74 
 
 
225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  41.74 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  41.74 
 
 
225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  45.69 
 
 
235 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  39.81 
 
 
246 aa  164  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  39.53 
 
 
231 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  38.77 
 
 
240 aa  162  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.19 
 
 
245 aa  162  9e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  50.26 
 
 
224 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  39.19 
 
 
245 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  38.12 
 
 
221 aa  160  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  41.74 
 
 
253 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  39.73 
 
 
243 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  39.73 
 
 
243 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  38.7 
 
 
227 aa  159  7e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  47.37 
 
 
246 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  39.65 
 
 
240 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.04 
 
 
248 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  42.29 
 
 
228 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  39.04 
 
 
237 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  49.3 
 
 
248 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  50.43 
 
 
232 aa  156  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1714  Ribonuclease III  44.12 
 
 
229 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.61541  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  42.79 
 
 
248 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  38.6 
 
 
248 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  42.61 
 
 
229 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  44.08 
 
 
237 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  42.61 
 
 
229 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  43.81 
 
 
229 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  45.06 
 
 
252 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  42.67 
 
 
241 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  46.41 
 
 
260 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  41.63 
 
 
234 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  34.27 
 
 
246 aa  153  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  46.78 
 
 
268 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  42.52 
 
 
233 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  39.33 
 
 
271 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  44.39 
 
 
229 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>