More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1387 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  53.12 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  53.57 
 
 		 229 aa  234  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  52.25 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  50.88 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  53.1 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  44.39 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  42.73 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  39.47 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  40.36 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  43.5 
 
 		 225 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  43.5 
 
 		 225 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  41.78 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  42.22 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  36.68 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.66 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.35 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  42.04 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  41.18 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  42.29 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  41.55 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  39.58 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  38.67 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  40.09 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  38.05 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  38.84 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  40.87 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  38.22 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  39.47 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  40.97 
 
 		 226 aa  157  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  38.22 
 
 		 224 aa  158  9e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  41.48 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  41.48 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  41.48 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  41.48 
 
 		 245 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  40.97 
 
 		 226 aa  157  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  36.84 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  38.91 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  41.05 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  41.05 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  41.05 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  41.05 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  41.05 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  41.92 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  41.52 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  37.72 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  40.61 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  43.46 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  40.53 
 
 		 259 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  39.46 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  38.53 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  40.83 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  36.68 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  41.28 
 
 		 242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  39.01 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  39.82 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  40 
 
 		 242 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  38.05 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  38.6 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2990  ribonuclease III  42.61 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  39.65 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  40.97 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  41.56 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  44.74 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  36.4 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  40.76 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0374  ribonuclease III  39.04 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.7646  hitchhiker  0.000724257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  39.13 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  42.99 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  35.37 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  36.61 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  35.37 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  40.71 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  39.44 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  38.67 
 
 		 377 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  37.5 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  40.71 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  39.44 
 
 		 383 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0034  ribonuclease III  38.26 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  39.91 
 
 		 229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  40 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  40 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  38.94 
 
 		 282 aa  144  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  38.7 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  39.91 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  35.87 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  38.5 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  35.34 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  39.35 
 
 		 385 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  39.73 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  37.61 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  42.47 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  41.04 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0333  ribonuclease III  38.53 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.283295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  39.38 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  37.56 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  37.83 
 
 		 259 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0367  ribonuclease III  38.53 
 
 		 265 aa  141  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  45.11 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  38.84 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>