More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1609 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  100 
 
 		 252 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  72.09 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  67.91 
 
 		 234 aa  281  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  64.49 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  66.08 
 
 		 239 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  59.91 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  60.99 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  58.3 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  59.66 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  56.68 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  57.14 
 
 		 276 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  58.3 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  57.47 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  57.56 
 
 		 252 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  56.42 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  58.04 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  56.07 
 
 		 262 aa  231  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  58.26 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  56.14 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  55.65 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  54.59 
 
 		 243 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  55.72 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  59.81 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  57 
 
 		 235 aa  218  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  56.57 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  56.57 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  56.57 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  56.09 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  58.12 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  53.25 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  54.77 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  53.73 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  51.71 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  57.28 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  56.62 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  45.54 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  44.8 
 
 		 242 aa  181  9.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  47.56 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  47.71 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  46.22 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  44.86 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  43.69 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  42.92 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  44.84 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.43 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  41.78 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  41.33 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  43.56 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.24 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  36.62 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  48.53 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  39.37 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  38.33 
 
 		 245 aa  166  5e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  45.63 
 
 		 262 aa  165  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  43.28 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  41.23 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  44.34 
 
 		 385 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  44.34 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  45.24 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  44.34 
 
 		 383 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  42.18 
 
 		 221 aa  158  9e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  43.81 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  44.14 
 
 		 377 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  42.86 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  39.38 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  41.15 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  45.78 
 
 		 232 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  42.54 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  40.79 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  41.23 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  38.86 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.37 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  37.66 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  38.81 
 
 		 223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  37.5 
 
 		 243 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  40.57 
 
 		 245 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  37.5 
 
 		 243 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  36.82 
 
 		 248 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  37.69 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  43.06 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  45.78 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  38.94 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  45.23 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  44.09 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  43.78 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  35.68 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  36.16 
 
 		 240 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  40.09 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  39.56 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  42.86 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  37.38 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  40.58 
 
 		 231 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>