More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1159 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  100 
 
 		 233 aa  484  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  52.04 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  52 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  46.29 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  49.55 
 
 		 245 aa  218  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  49.32 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  50 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  50 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  50 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  50 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  49.09 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  49.09 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  50 
 
 		 245 aa  215  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  50 
 
 		 245 aa  215  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  49.55 
 
 		 245 aa  214  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  46.49 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  44.3 
 
 		 236 aa  211  9e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1565  ribonuclease III  45.54 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  50.99 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  52.29 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  42.99 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  42.31 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  40.09 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  41.7 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  41.7 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  41.59 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.77 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  41.78 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  41.78 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  43.05 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.74 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  42.27 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  43.32 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  40.44 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  38.36 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  37.9 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  38.5 
 
 		 235 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  39.13 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  37.27 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  40.72 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  40.27 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  36.2 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  40.27 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  36.21 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  35.37 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.65 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  39.34 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  38.5 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  37.66 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  37.12 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  36.52 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  38.22 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  39.91 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  40.99 
 
 		 242 aa  148  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  42.36 
 
 		 385 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0492  ribonuclease III  36.94 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.863648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  42.36 
 
 		 383 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  42.36 
 
 		 383 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  38.33 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  39.32 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  40.98 
 
 		 377 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  38.39 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  38.94 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  37.14 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  34.98 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  37.07 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  36.41 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  37.33 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  37.05 
 
 		 222 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  37.93 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  33.77 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  36.68 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  33.93 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  39.52 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  35.15 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  36.82 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0863  ribonuclease III  39.22 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.016205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1007  ribonuclease III  39.22 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0279333 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  33.48 
 
 		 248 aa  138  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  36.57 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  35.24 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  37.16 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  37.02 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  36.8 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  34.07 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  38.89 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  35.14 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  40.67 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  35.43 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  36.44 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  35.24 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  33.62 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  36.36 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  37.04 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  37.56 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  36.87 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  37.63 
 
 		 276 aa  131  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  32.22 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  37.68 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  36.68 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>