More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1041 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  100 
 
 		 242 aa  492  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  76.57 
 
 		 242 aa  358  4e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  52.14 
 
 		 234 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  49.36 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  48.72 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  48.47 
 
 		 240 aa  204  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  45 
 
 		 240 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  49.16 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  48.65 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  48.87 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  48.06 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  45.76 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  47.06 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  44.8 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  45.45 
 
 		 246 aa  180  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  44.49 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  48.45 
 
 		 306 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  48.02 
 
 		 270 aa  177  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  48.25 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  46.64 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  42.86 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  47.03 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  47.8 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  48.28 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  45.38 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  43.5 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  51.3 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  51.3 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  51.3 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  45.31 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  47.67 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  46.22 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  47.42 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  41.63 
 
 		 242 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  41.63 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  42.18 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  41.28 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  39.91 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  37.24 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  39.43 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  41.26 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  40.99 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  42.59 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  40.83 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  44.85 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  41.78 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  38.5 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  38.63 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  40.19 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  40.43 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  43.07 
 
 		 250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  39.18 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  39.13 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  41.04 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  38.57 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  43.5 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  37.8 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  39.73 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  39.91 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  39.73 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  40.78 
 
 		 226 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  40.55 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  36.32 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  37.84 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  40.78 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  39.7 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  40.29 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  40.29 
 
 		 226 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  38.07 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  33.33 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  38.7 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  39.81 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  36.62 
 
 		 241 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  35.87 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  41.09 
 
 		 229 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  36.15 
 
 		 241 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  39.9 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  39.81 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  38.76 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  36.65 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  36.65 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  36.73 
 
 		 225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  37.44 
 
 		 236 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  36.52 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  38.83 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  38.83 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  38.83 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  35.35 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  37.5 
 
 		 377 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  35.81 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  36.52 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  38.83 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  40.49 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  38.39 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  32.16 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  44.65 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  37.91 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  39.13 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  37.91 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>