More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0780 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  51.56 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  52.29 
 
 		 233 aa  217  8.999999999999998e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  51.82 
 
 		 231 aa  211  9e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  49.78 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  48.43 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  50.22 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  49.55 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  50.22 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  49.78 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  50.22 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  49.78 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  50.22 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  50.22 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  50.22 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  50.22 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  49.78 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  50.22 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  48.87 
 
 		 235 aa  185  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  48.88 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1565  ribonuclease III  43.06 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  48.53 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  42.73 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  39.11 
 
 		 235 aa  157  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  41.74 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  41.63 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0492  ribonuclease III  37.95 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.863648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  41.23 
 
 		 243 aa  154  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  41.23 
 
 		 243 aa  154  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  43.66 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  43.72 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  38.64 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  39.25 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  41.71 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  39.19 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  38.22 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  41.26 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  39.56 
 
 		 377 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  40.78 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  42.99 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  38.03 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.73 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  41.78 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  36.48 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  40 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  38.94 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  41.26 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  40.87 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  40.44 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  41.74 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  40.97 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  39.25 
 
 		 385 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  37.38 
 
 		 241 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  37.38 
 
 		 241 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  37.73 
 
 		 246 aa  134  9e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  40.53 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  36.67 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  41.04 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  38.22 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  38.79 
 
 		 383 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  39.37 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  36.45 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  37.38 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  38.79 
 
 		 383 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  36.65 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  38.22 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  37.61 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  36.53 
 
 		 256 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  36.7 
 
 		 256 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  36.11 
 
 		 300 aa  131  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  36.84 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  37.39 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  38.12 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  36.24 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  36.49 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  39.63 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  40 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  38.22 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  35.45 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  36.32 
 
 		 228 aa  128  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  38.86 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0196  ribonuclease III  36.79 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.483846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  39.11 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  37.33 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  35.58 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  36.54 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  37.67 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  36.41 
 
 		 256 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  38.64 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  38.64 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  36.24 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  34.7 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  34.25 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  36.89 
 
 		 262 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  35.62 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  35.62 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  35.81 
 
 		 279 aa  122  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  34.09 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  35.41 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  33.33 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>