More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0196 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0196  ribonuclease III  100 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.483846  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0492  ribonuclease III  38.26 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.863648  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  37.43 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  36.65 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  32.89 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  33.96 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  36.48 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  33.96 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  34.76 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  32.07 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  35.62 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  36.06 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  29.82 
 
 		 245 aa  108  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  32.74 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  36.07 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  34.72 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  31.19 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  31.19 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  34.76 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  29.33 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  31.98 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  35.02 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  35.85 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  31.5 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  31.5 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  31.5 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  31.5 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  31.5 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  31.5 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  33.18 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  31.5 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  31 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  31 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  34.42 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  31.02 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  34.42 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  34.42 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  34.23 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  34.42 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  31.82 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  33.78 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  33.78 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  33.78 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  35.78 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  33.03 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  30.5 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  30.93 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  31.28 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  32.02 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  32.88 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  33.18 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  32.43 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  32.57 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  33.47 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  30.73 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  31.34 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  32.63 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  33.19 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  33.48 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  32.74 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  31.65 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  32.33 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  32.44 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  31.28 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  31.6 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  33.81 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  32.86 
 
 		 377 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  29.29 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  31.19 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  33.64 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  33.63 
 
 		 262 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  37.95 
 
 		 253 aa  92  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  29.72 
 
 		 279 aa  92  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  29.58 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  29.41 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  30.99 
 
 		 300 aa  90.9  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  35 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  32.41 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  33 
 
 		 383 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  32.46 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  32.46 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  33 
 
 		 383 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  34.09 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  31.19 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  29.91 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  34.09 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  34.09 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  29.36 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  28.64 
 
 		 276 aa  88.6  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  32.27 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  29.55 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  28 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  30.88 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  28.91 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  29.52 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  30.17 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  31.61 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  27.91 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  28.51 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  30 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>