More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10070 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  100 
 
 		 300 aa  609  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  74.58 
 
 		 281 aa  351  1e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  74.32 
 
 		 279 aa  349  4e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  55.45 
 
 		 243 aa  238  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  37.95 
 
 		 246 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  39.19 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  38.18 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  37.67 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  37.33 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  40.37 
 
 		 235 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  39.45 
 
 		 241 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  39.45 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  36.12 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  35.85 
 
 		 231 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  38.96 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.28 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  35.22 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  39.42 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  39.51 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  36.28 
 
 		 245 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  37.86 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  37.86 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  37.86 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  37.86 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  37.86 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  37.86 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  37.86 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  35.45 
 
 		 229 aa  136  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  37.86 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  35.53 
 
 		 246 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  35.32 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  35.43 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  37.86 
 
 		 245 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  36.36 
 
 		 235 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  35.32 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  38.18 
 
 		 222 aa  135  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  38.22 
 
 		 231 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  35.56 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  37.96 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  32.42 
 
 		 226 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  35.38 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  35.38 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  33.04 
 
 		 223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  35.98 
 
 		 233 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  38.68 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  37.5 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  34.5 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  35.93 
 
 		 246 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  36.02 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  34.8 
 
 		 233 aa  129  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  34.91 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  34.8 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  36.19 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  36.82 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  35.09 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  31.28 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  37.38 
 
 		 232 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  34.4 
 
 		 232 aa  126  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  35.82 
 
 		 234 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  35.59 
 
 		 224 aa  126  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  31.44 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  35.35 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  33.17 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  35.59 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  34.22 
 
 		 236 aa  125  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  36.21 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  37.84 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  31.86 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  35.5 
 
 		 240 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  36.45 
 
 		 245 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  31.42 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  32.42 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  36.45 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  34.42 
 
 		 229 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2525  ribonuclease III  33.93 
 
 		 223 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  34.74 
 
 		 230 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  35.84 
 
 		 246 aa  122  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  37.8 
 
 		 221 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  34.91 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  35.64 
 
 		 262 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  36.79 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  32.6 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  35.94 
 
 		 226 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  35.51 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  35.93 
 
 		 240 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  37.09 
 
 		 271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  33.49 
 
 		 230 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3916  ribonuclease III  34.33 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  33.04 
 
 		 223 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  34.42 
 
 		 229 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  32.02 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  33.48 
 
 		 227 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  34.91 
 
 		 240 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0780  ribonuclease III  34.8 
 
 		 226 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.30965e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  32.86 
 
 		 226 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  32.03 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  36.15 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  37.26 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  35.68 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  38.66 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>