More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1366 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  100 
 
 		 281 aa  556  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  76.52 
 
 		 279 aa  360  1e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  67.02 
 
 		 300 aa  357  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  53.33 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  43.14 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  34.72 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  43.11 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  36.16 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  35 
 
 		 232 aa  143  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  37.9 
 
 		 246 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  38.1 
 
 		 241 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  38.1 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  36.8 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  36.41 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  38.53 
 
 		 246 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  37.67 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  40.27 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  39.91 
 
 		 221 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  37.67 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  36.77 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  37.79 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  37.67 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  35.74 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  40.91 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  37.56 
 
 		 245 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  37.56 
 
 		 245 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  37.78 
 
 		 235 aa  135  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  37.56 
 
 		 245 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  37.56 
 
 		 245 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  36.7 
 
 		 221 aa  135  9e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  41.33 
 
 		 226 aa  135  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  35.07 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  37.5 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  37.22 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  42.86 
 
 		 368 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  37.22 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  37.1 
 
 		 245 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  34.96 
 
 		 236 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  35.38 
 
 		 231 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  39.91 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  38.46 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  37.04 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  36.04 
 
 		 223 aa  132  9e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  38.86 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  35.56 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  39.91 
 
 		 221 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  37.07 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  36.32 
 
 		 234 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  34.88 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  34.4 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  38.32 
 
 		 232 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  34.54 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  38.5 
 
 		 226 aa  126  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  33.93 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  35.91 
 
 		 222 aa  126  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  35.02 
 
 		 229 aa  126  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  36.82 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  37.12 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  38.28 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  38.29 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  38.6 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  34.3 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  34.25 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  37.22 
 
 		 228 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  34.55 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  37.61 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  35.91 
 
 		 236 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  37.61 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  35.98 
 
 		 233 aa  122  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  31.94 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  36.82 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  34.06 
 
 		 259 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  31.94 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  35.71 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  35.56 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  35.53 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  37.61 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  34.22 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  32.56 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  34.08 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  38.6 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  36.04 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  36.53 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  32.56 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  37.02 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  34.08 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  37.04 
 
 		 230 aa  118  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  33.88 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  32.42 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  32.61 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  36.82 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  36.82 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1092  ribonuclease III  39.78 
 
 		 409 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  35.65 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  32.54 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  32.74 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4246  ribonuclease III  39.78 
 
 		 408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0654  ribonuclease III  39.78 
 
 		 409 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.988138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1134  ribonuclease III  39.78 
 
 		 409 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  36.82 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>