More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0250 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  100 
 
 		 221 aa  427  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  60.26 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  49.54 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  49.07 
 
 		 256 aa  175  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  46.43 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  45.54 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  47.25 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  47.89 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  47.44 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  47.73 
 
 		 259 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  45.29 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  45.33 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  43.46 
 
 		 368 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  43.26 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  46.05 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  47.24 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  45.41 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  42.92 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  43.72 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  45.19 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  44.98 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4122  ribonuclease III  41.98 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  43.66 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  42.86 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  45.41 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  43.26 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  44.95 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  44.6 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  41.67 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  36.61 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  42.92 
 
 		 272 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  42.2 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  43.54 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  43.54 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  44.98 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  44.65 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  44.98 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  46.26 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3061  ribonuclease III  41.74 
 
 		 233 aa  148  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  44.98 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  36.77 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3149  ribonuclease III  44.44 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000776488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1054  ribonuclease III  39.35 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0953416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  42.72 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  36.62 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  39.01 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  41.86 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  42.4 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  38.57 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  43.52 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  40.18 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  42.42 
 
 		 246 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  38.43 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0734  ribonuclease III  37.96 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0114504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2975  ribonuclease III  44.24 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00170504  hitchhiker  0.00754361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  46.51 
 
 		 244 aa  144  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  40.28 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  41.2 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  42.86 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  42.86 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  39.81 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  41.2 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  42.13 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  38.39 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  38.36 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  41.35 
 
 		 282 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  43.06 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  40.28 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  40.72 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3635  ribonuclease III  42.13 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  38.5 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  38.29 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0640  ribonuclease III  38.79 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.394276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  41.28 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  42.6 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  40.64 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01717  ribonuclease III  42.33 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  45.12 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1947  ribonuclease III  47.73 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  40.74 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  40.18 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  39.35 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  36.16 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  42.66 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  39.81 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1148  ribonuclease III  38.14 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00543431  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  42.53 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  40.37 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  42.65 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  39.81 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  38.89 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  42.53 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  40 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  39.52 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  38.6 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  40.59 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  39.45 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  39.91 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  41.28 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  48.84 
 
 		 226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>