More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0950 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0950  ribonuclease III  100 
 
 		 238 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.812392  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0661  ribonuclease III  56.49 
 
 		 245 aa  258  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0654  ribonuclease III  58.48 
 
 		 257 aa  255  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2627  ribonuclease III  56.7 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273317  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0682  ribonuclease III  55.61 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1449  ribonuclease III  55.66 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.558128  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  51.53 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0998  ribonuclease III  54.21 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.272125  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1151  ribonuclease III  54.21 
 
 		 239 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  46.25 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  43.53 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  43.59 
 
 		 271 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2874  ribonuclease III  44.34 
 
 		 226 aa  174  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  44.34 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0991  Ribonuclease III  46.61 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  43.13 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1571  ribonuclease III  43.32 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.325561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2441  ribonuclease III  44.09 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  47 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  43.78 
 
 		 272 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2549  Ribonuclease III  45.37 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0995816  normal  0.0357847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  43.78 
 
 		 368 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  45.37 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6614  ribonuclease III  45.41 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.347732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0522  ribonuclease III  43.93 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0419  ribonuclease III  46.51 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  46.15 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3881  ribonuclease III  42.49 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7363  ribonuclease III  44.24 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1918  ribonuclease III  41.38 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.669421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1213  ribonuclease III  44.55 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0200  ribonuclease III  46.81 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2571  ribonuclease III  43.69 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.125907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2251  ribonuclease III  41.81 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.305746  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1675  RNAse III  45.19 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  42.51 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0308  ribonuclease III  45.19 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  39.04 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  34.4 
 
 		 226 aa  142  7e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  35.32 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  42.66 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  43.44 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2559  RNAse III  42.65 
 
 		 242 aa  138  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190947  hitchhiker  0.00165454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  44.28 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  43.69 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  39.17 
 
 		 259 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  35.51 
 
 		 236 aa  136  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  38.43 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  40.43 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  39.29 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  35.68 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  38.94 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  33.18 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  39.34 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  41.01 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  39.15 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  39.15 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  42.72 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0373  Ribonuclease III  38.86 
 
 		 249 aa  128  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  0.561296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  38.68 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  38.68 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1348  ribonuclease III  38.39 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  40.74 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  36.68 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  39.73 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1831  ribonuclease III  38.07 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  37.26 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  39.35 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1834  ribonuclease III  38.07 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  38.39 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  39.27 
 
 		 235 aa  124  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  36.74 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  38.71 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  34.12 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1246  ribonuclease III  39.62 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  36.97 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  40 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  38.65 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  38.65 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  38.65 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  35.32 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  40 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  35.38 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  38.71 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  38.76 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  33.49 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  37.81 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  36.49 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  38.74 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  34.23 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  39.27 
 
 		 228 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  36.45 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  35.38 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  35.37 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  33.19 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  35.85 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  33.94 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  38.99 
 
 		 243 aa  118  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  38.71 
 
 		 377 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  39.05 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>