More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1144 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  90.39 
 
 		 229 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  89.96 
 
 		 229 aa  408  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  72.12 
 
 		 227 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  47.52 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  48.88 
 
 		 246 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  46.82 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  48.47 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  49.12 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  50 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  50 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  49.12 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  48.67 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  50 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  49.12 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  48.67 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  50 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  46.12 
 
 		 235 aa  184  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  47.35 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  41.92 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  43.5 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  40.61 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  40.61 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  46.26 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  48.15 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  42.67 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  44.14 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  41.78 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  43.48 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  42.11 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  41.55 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  44.91 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  40.91 
 
 		 231 aa  167  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  37.23 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  41.23 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  44.25 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  38.89 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  37.74 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  46.89 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  39.91 
 
 		 241 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  39.45 
 
 		 241 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  42.23 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  43.56 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  39.91 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  39.45 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  42.65 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  35.16 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  40.95 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  37.07 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  34.36 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  35.53 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  40.72 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  37.05 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  39.48 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  33.05 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  41.46 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  35.68 
 
 		 252 aa  137  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  39.34 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  36.24 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  33.93 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  34.78 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  38.7 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0659  ribonuclease III  39.53 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0117044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  37.14 
 
 		 383 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  36.04 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  36.04 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  37.14 
 
 		 383 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  36.56 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  41.82 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  33.77 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  33.33 
 
 		 246 aa  134  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  37.61 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  36.02 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  36.67 
 
 		 385 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  34.84 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  38.22 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  37.61 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  41.48 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  36.89 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  35.89 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  35.59 
 
 		 377 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  39.21 
 
 		 306 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  41.05 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  41.05 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  36.06 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  35.17 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  40.29 
 
 		 248 aa  131  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  32.72 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0570  ribonuclease III  36.24 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  34.91 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  34.39 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  34.65 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  42.23 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  39.38 
 
 		 222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  35.02 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0492  ribonuclease III  36.21 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.863648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  36.6 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  37.62 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1565  ribonuclease III  34.07 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  36.08 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>